Využití mikrosatelitních markerů pro studium populační struktury jelenovitých v západních Karpatech

Mgr. Alžběta Gřundělová

Diplomová práce

The use of microsatellite markers for the study of the deer population structure in the Western Carpathians

Anotace:

Cílem práce byla analýza jaderných mikrosatelitních markerů, které byly zpracovány metodami krajinné genetiky a následně srovnány s mitochondriálními sekvencemi (mtDNA) z dřívějšího výzkumu.Mikrosatelitní analýza proběhla za použití 11 mikrosatelitních sekvencí s celkovým počtem 188 alel. Celkem bylo analyzováno 94 jedinců, kteří byli rozděleni do 3 subpopulací. Průměrná očekávaná heterozygotnost 0,82 a průměrná pozorovaná heterozygotnost celé populace nabyla hodnotu 0,72. Mezi subpopulacemi probíhá genový tok. Dopravní infrastruktura ovlivňuje v malé míře tok genů.

Abstract:

The aim of this work was to analyze nuclear microsatellite markers, which were processed by methods of landscape genetics and then compared with mitochondrial sequences (mtDNA) from previous research.Microsatellite analysis was performed using 11 microsatellite sequences with a total of 188 alleles. A total of 94 individuals were analyzed, divided into 3 subpopulations. The average expected heterozygosity of 0.82 and the average observed heterozygosity of the whole population was 0.72. There is a gene flow between the subpopulations. Transport infrastructure affects the flow of genes to a small extent.

Klíčová slova

Cervus elaphus, mikrosatelitní markery, mt DNA, Západní Karpaty

Keywords

Cervus elaphus, microsatellite markers, mtDNA, Western Carpathians

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 4. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Martin Ernst, Ph.D.

Mendelova univerzita v Brně

Lesnická a dřevařská fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Lesní inženýrství / Lesní inženýrství