Geny antibiotické rezistence a jejich detekce v procesu biokonverze hnoje larvou Hermetia illucens

Bc. David Zimčík

Master's thesis

The antibiotic resistance genes and their detection during manure bioconversion by Hermetia illucens

Anotácia:

Tato diplomová práce se snaží sledovat dynamiku výskytu genů macrolidové rezistence v průběhu biokonverze kravské mrvy larvou Hermetia illucents v rozsahu 32dní. Tento rozsah je oproti publikovaným studiím více jak dvojnásobný. Teoretická část práce informuje o riziku, které přináší multirezitentní kmeny bakterií. Součástí teorie je také obecný přehled mechanismů působení antibiotik, mechanismů rozvoje a způsoby šíření antibiotické rezistence. Praktická část se věnuje získání genu makrolidové rezistence, který bude použit jako standard pro absolutní kvantifikaci metodou qPCR. Velká část práce byla zaměřena na optimalizaci metody qPCR. Cílem této práce bylo stanovit míru vlivu larev na dynamiku genů rezistence.

Abstract:

This master thesis investigates the dynamics of macrolide resistance genes during the biocon-version of cow dung by Hermetia illucents larva over a 32-day period. This range is more than double that of published studies. The theoretical part of the study informs about the risk asso-ciated with superbugs. The theory also includes a general review of the mechanisms of antibi-otic action, mechanisms of development and ways in which antibiotic resistance spreads. The practical part is dealing with the acquisition of macrolide resistance genes, which will be used as a standard for absolute quantification by qPCR. A large part of the work was focused on the optimization of the qPCR method. The aim of this work was to determine the level of in-fluence of larvae on the dynamics of resistance genes.

Kľúčové slová

Antibiotická rezistence, Antibiotika, Hermetia illucens, Hnůj (mrva), Geny antibiotické rezistence, Makrolidy, qPCR Antibiotic resistence, Macrolides, manure, Antibiotics

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 4. 1. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 2. 2. 2023
• Vedúci: Mgr. Jana Vašíčková, Ph.D.
• Oponent: Ing. Marie Smutná, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biochemistry / Genomics and Proteomics