Automatická analýza kanálů transmembránových proteinů – Bc. Zdenko Olšovský
Bc. Zdenko Olšovský
Bakalářská práce
Automatická analýza kanálů transmembránových proteinů
Automatic analysis of transmembrane protein channels
Anotace:
Cílem této bakalářské práce bylo navrhnout a implementovat softwarový nástroj pro automatickou analýzu transmembránových proteinů – Pore Finder. Ten je schopen automatické analýzy transmembránových proteinů s využitím databází OPM a PDB. Pro jeho implementaci bylo využito WebChemistry API vyvíjené na pracovišti školitele. Pore Finder automaticky detekuje póry v transmembránových proteinech, a určuje …víceAbstract:
The aim of this bachelor thesis was to develop a software tool for automatic analysis of transmembrane proteins. The developed program, Pore Finder, is capable of automatic analysis of transmembrane proteins with utilization of OPM and PDB databases where the core of the program is based on the WebChemistry API. Subsequently is able to provide computed pores with physicochemical characteristics which …více
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 18. 5. 2015
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/vop2p/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 19. 6. 2015
- Vedoucí: RNDr. Lukáš Pravda
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaBakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Chemoinformatika a bioinformatika
Práce na příbuzné téma
-
Analýza tunelů a pórů v proteinech
Eliška Špačková -
Vizualizace biomakromolekul
David Sehnal