Bc. Anna ŠPAČKOVÁ

Master's thesis

Struktura a vizualizace proteinových tunelů

Structure and visualization of protein tunnels
Abstract:
Práce analyzuje struktury tunelů v proteinech v databázi ChannelsDB a z výsledků MOLEonline spolu s jejich vlastnostmi a predikcí možných procházejících molekul. Dalším cílem bylo napsat program, který vizualizuje tunely ve 2D reprezentaci spolu s aminokyselinovým zastoupením na povrchu tunelu v proteinech. Dosažení výsledků bylo uskutečněno především pomocí vlastních kódů napsaných v programovacím …more
Abstract:
This work analyzes the structures of tunnels in proteins in the ChannelsDB database and results from MOLEonline, along with their properties and predictions of possible passing molecules. Another goal was to write a program that visualizes tunnels in a 2D representation along with the amino acid representation on the tunnel surface in proteins. Achieving the results was primarily accomplished using …more
 

Keywords

Tunely póry kanály protein aminokyselina enzym substrát transport fyzikálně-chemické vlastnosti úzké hrdlo molekula ionty ligandy.
 
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 19. 5. 2022

Thesis defence

  • Supervisor: doc. RNDr. Karel Berka, Ph.D.

Citation record

Cite this text
The right form of listing the thesis as a source quoted

ŠPAČKOVÁ, Anna. Struktura a vizualizace proteinových tunelů. Olomouc, 2022. diplomová práce (Mgr.). UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI, Přírodovědecká fakulta
https://stag.upol.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=271415 Reference to the local database file of the institution

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Master programme / field:
Biochemistry / Bioinformatics

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.
 
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights
Theses 3rr7ss 3rr7ss/2
19/5/2022
Folders
Files
thesis Anna_Spackova_diplomova_prace.pdf
MARKLOVÁ, E.
20/5/2022

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.