Aplikace pro zobrazování ligandů ve strukturách proteinů – Bc. Petr Potěšil
Bc. Petr Potěšil
Diplomová práce
Aplikace pro zobrazování ligandů ve strukturách proteinů
Application for visualization of ligands in protein structures
Anotace:
Cílem diplomové práce bylo vytvořit aplikaci pro vizualizaci ligandů na strukturách proteinů. Ligandy jsou hledány na zadané proteinové struktuře a na strukturách podobných. Tyto struktury jsou získávány z PDB databáze. Výstupem aplikace je skript pro aplikaci PyMol, který zobrazí všechny nalezené ligandy, použité struktury a nejzajímavější residua. Součástí výstupu je také soubor se všemi zajímavými …víceAbstract:
The goal of this diploma thesis was to create an application for visualization of ligands in protein structures. Ligands are searched in the given protein structure and also in similar structures. These structures are obtained from PDB database. The output of this application is the PyMol script that displays all ligands, used structures and the most important residues. The output also contains file …více
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 9. 1. 2012
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/yixrh/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 8. 2. 2012
- Vedoucí: RNDr. Antonín Pavelka, Ph.D.
- Oponent: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasarykova univerzita
Fakulta informatikyMagisterský studijní program / obor:
Informatika / Informační systémy
Práce na příbuzné téma
-
Proteinová krystalografie a studium interakce protein/ligand za pomoci NMR technik
David Buchta -
Quantum Mechanical Investigation of Non-Covalent Interaction in Protein-Ligand and Nanomaterial Complexes
Saltuk Mustafa EYRILMEZ -
Studium nekovalentních interakcí protein-ligand pomocí hmotnostní spektrometrie
Petra ZAPLETALOVÁ -
Nové metody výpočtů volných energií pro studium interakcí protein-ligand
Daniela Toulcová