Denisa KROUPOVÁ

Bachelor's thesis

Automatizace trypsinové digesce v proteomice

Automatization of trypsin digestion in proteomics
Abstract:
Bakalářská práce se zabývá automatizací a optimalizací trypsinové digesce v bottom-up proteomickém protokolu. Srovnává tři metody - štěpení v roztoku, štěpení na filtru (FASP) a přípravu pomocí robota Tecan - a stanovuje počet peptidů, sekvenční pokrytí a účinnost, aby se zjistilo, která metoda dosahuje nejvyšší efektivity
Abstract:
This bachelor thesis is focused on the automatization and optimalization of trypsin digestion in bottom-up proteomics. It compares three methods - in-solution digestion, filter-based digestion (FASP) and Tecan robot preparation - and determines the number of peptides, sequence coverage and efficiency in order to find out which method is the most effective
 

Keywords

Bottom-up proteomika peptidy štěpení v roztoku FASP Tecan trypsin hmotnostní spektrometrie
 
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 5. 6. 2020

Thesis defence

  • Supervisor: Mgr. Tomáš Oždian, Ph.D.

Citation record

Cite this text
The right form of listing the thesis as a source quoted

KROUPOVÁ, Denisa. Automatizace trypsinové digesce v proteomice. Olomouc, 2020. bakalářská práce (Bc.). UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI, Přírodovědecká fakulta
https://stag.upol.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=254362 Reference to the local database file of the institution

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biochemistry / Biotechnology and Gene Engineering

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.
 
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights
Theses 4q5hus 4q5hus/2
8/6/2020
Folders
Files
thesis Automatizace_trypsinove_digece_v_proteomice_2020_Kroupova.pdf
MARKLOVÁ, E.
9/6/2020

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.