Editace stafylokokových genomů pomocí CRISPR / Cas systémů

Bc. Hana Šimečková

Diplomová práce

Staphylococcal genome editing using the CRISPR / Cas systems

Anotace:

Bakterie rodu Staphylococcus jsou běžnou součástí mikrofóry člověka i zvířat, některé však mohou způsobovat řadu infekčních onemocnění. Cílená manipulace s genomy těchto druhů může významně přispět k vývoji nových léčebných strategií. Jednou z nejnovějších metod editace genomů eukaryot i prokaryot představují nástroje odvozené od CRISPR/Cas. Tato diplomová práce se zabývá bakteriálními CRISPR/Cas systémy a jejich využitím v modifikaci bakteriálních genomů. Cílem bylo navržení a konstrukce plazmidového vektoru vhodného pro editaci safylokoků. Byl vytvořen dvouvektorový editační systém, který obsahuje gen cas9 ze Streptococcus pyogenes a dva geny pro gRNA.

Abstract:

Bacteria of the genus Staphylococcus are a common part of human and animal microflora, but occasionally they can cause whole spectrum of infectious diseases. Targeted manipulation with genomes of these species can make a significant contribution to the development of new therapeutic strategies. One of the most recent methods of editing eukaryotes and prokaryotes is the CRISPR/Cas-derived tools. This diploma thesis deals with bacterial CRISPR/Cas systems and their use in modifying bacterial genomes. The aim was to design and construct a plasmid vector suitable for editing Staphylococci. A two-vector editing system has been constructed containing the cas9 gene from Streptococcus pyogenes and two genes for gRNA.

Klíčová slova

Staphylococcus aureus, CRISPR/Cas, SpCas9, editace bakteriálních genomů, delece, mutageneze, bacteria genome editing, deletion, mutagenesis

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 5. 6. 2018
• Vedoucí: Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Bc. Darina Čejková, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Experimentální biologie / Molekulární biologie a genetika