Srovnávací genomika trav, současné trendy a aplikace poznatků

Mgr. Jana Simandlová

Bakalářská práce

Comparative genomics of cereals and applications

Anotace:

Bakalářská práce se zabývá aktuálními trendy srovnávací genomiky modelových i kulturních druhů čeledě Poaceae. V práci jsou shrnuty informace o genomech významných zástupců této čeledě a současné poznatky o jejich evoluci a o syntenii jednotlivých druhů. Jsou zde také popsány hlavní nástroje využívané při analýze těchto genomů, a to mutageneze jako nástroj studia funkcí genů, genetické a fyzické mapování a sekvenování jako nástroje studia struktury genomů. V oblasti sekvenování jsou popsány současné možnosti sekvenování nové generace. Práce se také zaměřuje na možné aplikace získaných poznatků v zemědělství a šlechtění.

Abstract:

The thesis deals with the current trends of comparative genomics of models and crops from the family Poaceae. The thesis summarizes information about significant cereal genomes and knowledge about their evolution and synteny. Main tools used for analysis of genomes, namely mutagenesis aimed at study of gene functions, genetic and physical mapping and sequencing considering up-to-date trends (e.g. next generation sequencing), are also described. The thesis is also focused on possible applications in agriculture and breeding.

Klíčová slova

DNA markery, evoluce, mutageneze, Poaceae, sekvenování, srovnávací genomika, syntenie, DNA markers, evolution, mutagenesis, sequencing, comparative genomics, synteny

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 11. 5. 2011

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 16. 6. 2011
• Vedoucí: doc. RNDr. Jana Řepková, CSc.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika