Návrh struktur vybraných makromolekul metodami výpočetní chemie – Bc. Jan PAUSWANG
Bc. Jan PAUSWANG
Master's thesis
Návrh struktur vybraných makromolekul metodami výpočetní chemie
Design of macromolecular structures using computational methods
Abstract:
Práce se zabývá vytvořením modelů polymerázy cytomegaloviru. Při vytváření modelu byl pro návrh struktury použit program I-TASSER. Simulace modelů probíhaly pomocí výpočtů založených na principech molekulové mechaniky v programu Amber. Templáty, na jejichž základě byly pomocí programu I-TASSER vytvořeny modely polymerázy, odpovídaly kódům 2gv9, 3iay a 4flw v PDB databázi. Byly vytvořeny dva modely …moreAbstract:
In this work the generating of model of polymerase of cytomegalovirus was studied. I-TASSER program was used to prediction of polymerase structure. Simulation of models were performed with program Amber using molecular mechanism principles. Structure of models is based on concrete structures of herpesvirus polymerase (2gv9), yeast (3iay) and archaebacteria (4flw). Models were prepared with DNA in two …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 4. 5. 2018
Thesis defence
- Supervisor: Mgr. Petra Kührová, Ph.D.
Citation record
The right form of listing the thesis as a source quoted
PAUSWANG, Jan. Návrh struktur vybraných makromolekul metodami výpočetní chemie. Olomouc, 2018. diplomová práce (Mgr.). UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI, Přírodovědecká fakultaPALACKÝ UNIVERSITY OLOMOUC
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Chemistry / Material Chemistry
Theses on a related topic
-
Předpověď stability proteinů pomocí kombinace strojového učení a molekulové mechaniky
Elkhan Malmanov -
Studium stability uhlíkových teček metodami molekulové mechaniky
Michal LANGER -
Studium komplexů proteinů metodami molekulového modelování
Veronika Lásková -
Studium konformačního chování amyloidu beta a jeho mutantů v pozici 35 metodami molekulového modelování
Libuše Dvořáková -
Studium molekulových interakcí v nukleových kyselinách: (deoxy)ribosa-báze a fosfát-báze
Klaudia Mráziková -
Studium molekulových interakcí v L1 ribosomálním stalku
Miroslav Krepl
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights