Studium stability uhlíkových teček metodami molekulové mechaniky

Michal LANGER

Bakalářská práce

Study of graphene dots via molecular mechanics method

Anotace:

Uhlíkové tečky jsou poměrně novým nula dimenzionálním uhlíkovým materiálem. Nicméně jsou atraktivním nanomateriálém pro studium, protože nabízí celou řadu aplikací. Zejména jejich luminiscenční vlastnosti jsou důvodem, proč jsou v centru pozornosti řady vědeckých center. My jsme v této práci studovali stabilitu multivrstevného modelu jednoho typu uhlíkových teček grafenových uhlíkových teček. K samotnému uchopení problému jsme použili metod molekulové mechaniky a dynamiky, jako výpočetní program nám posloužil Gromacs. Spočítali jsme interakční energie modelových struktur ve vakuu, také jsme analyzovali preferované konformace, které vrstvy vůči sobě vzájemně zaujímají. Ke kvantifikaci stability modelu uhlíkových teček ve vodě jsme vypočítali potenciál středních sil v závislosti na vzdalování vrstev od sebe.

Abstract:

Carbon quantum dots are relatively new zero dimensional carbon nanomaterials. However, they are very attractive material for study due to their huge possibility of application. In particular, their luminescent properties are the reason why the carbon dots are in the centre of attention of many scientific centres. In this work we studied the stability of multi-layer model of one type of C-dots graphene quantum dots. To grasp a problem we used molecular mechanics and dynamic methods and software Gromacs. We calculated interaction energies for our models in vacuum, we also analysed the preferred conformations which layers occupy to one another. To quantify the stability of carbon dots model in water, we calculated the potential of mean forces depending on the interlayer between two layers.

Klíčová slova

uhlíkové tečky, stabilita, molekulová mechanika a dynamika, Gromacs

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 9. 5. 2016

Zveřejnit od: 9. 5. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Mikuláš Kocman, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Chemie / Nanomateriálová chemie