Conformational Study of a Flexibility of the Fluorescence Dye QSY21 – Filip ZIMANDL
Filip ZIMANDL
Bakalářská práce
Conformational Study of a Flexibility of the Fluorescence Dye QSY21
Conformational Study of a Flexibility of the Fluorescence Dye QSY21
Abstract:
Tato bakalářská práce se týká teoretické studie flexibility fluorescenčního barviva QSY 21. Hlavním úkolem práce bylo najít energeticky nejstabilnější konformery ve vodném prostředí a poskytnout tak vhodnou startovní strukturu pro MD simulaci barviva navázaného na DNA. Dále byla spočtena bariéra rotace mezi centrálním xanthenovým kruhem a postranním aromatickým řetězcem. Výpočty prokázaly ve shodě …víceAbstract:
This bachelor thesis is focused on a theoretical study of the flexibility of the QSY 21 fluorescence dye. The main aim of this work was to find the most stable conformers of the isolated dye and thus provide the suitable starting structure of the dye for the MD simulation of the QSY 21 bound to the DNA. The torsion barrier between the central xanthene ring and the side ring was evaluated, showing the …více
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 24. 5. 2010
Zveřejnit od: 24. 5. 2010
Identifikátor:
20453
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 21. 6. 2010
Citační záznam
Citace dle ISO 690:
ZIMANDL, Filip. \textit{Conformational Study of a Flexibility of the Fluorescence Dye QSY21}. Online. Bakalářská práce. České Budějovice: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Přírodovědecká fakulta. 2010. Dostupné z: https://theses.cz/id/6abycv/.
Jak správně citovat práci
ZIMANDL, Filip. Conformational Study of a Flexibility of the Fluorescence Dye QSY21. Č. Bud., 2010. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta
Plný text práce
Právo: Autor si přeje zpřístupnit práci veřejnosti až od 24. 05. 2010
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- Soubory jsou od 24. 5. 2010 dostupné: světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakultaJIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH
Přírodovědecká fakultaBakalářský studijní program / obor:
Biochemistry / Biological Chemistry
Práce na příbuzné téma
-
Studium acetylcholinesterasy metodami výpočetní chemie
Jiří Wiesner -
Návrh struktur vybraných makromolekul metodami výpočetní chemie
Jan PAUSWANG -
Studium stability uhlíkových teček metodami molekulové mechaniky
Michal LANGER -
The impact of DNA methylation on the stability and dynamics of i-motif in the ILPR promoter region
Eva SÝKOROVÁ
Název
Vložil
Vloženo
Práva