Cílená metabolomická analýza vzorků krevních skvrn pacientů s deficitem acyl-CoA-dehydrogenasy mastných kyselin s krátkým řetězcem (SCADD)

Kateřina ZUZAŇÁKOVÁ

Bakalářská práce

Targeted metabolomic analysis of dry blood spots from patients with short-chain acyl-CoA dehydrogenase deficiency (SCADD)

Anotace:

Deficit acyl-CoA dehydrogenasy mastných kyselin s krátkým řetězcem (SCADD) se řadí mezi autosomálně recesivní poruchy mitochondriální -oxidace. Je způsoben mutacemi v genu ACADS. Onemocnění je doprovázeno různými klinickými symptomy (např. metabolickou acidosou, opožděným vývojem, záchvaty), případně mohou být pacienti zcela asymptomatičtí. Vzrůstá proto potřeba zavést SCADD mezi onemocnění, která se vyšetřují v rámci novorozeneckého screeningu České republiky. V praktické části byly cílenou metabolomickou analýzou, za využití kapalinové chromatografie ve spojení s tandemovou hmotnostní spektrometrií, hledány nové biomarkery onemocnění. Byly porovnávány suché krevní skvrny získané od novorozenců s diagnosou SCADD a kontrol. Data byla zpracována a statisticky vyhodnocena. Změny byly nalezeny v hladinách acylkarnitinů (butyrylkarnitin, decanoylkarnitin, decenoylkarnitin), organických kyselin (ethylmalonát, betain) a purinů (inosin, hypoxanthin, IMP). Kombinace těchto metabolitů může vést ke zvýšení selektivity pro záchyt onemocnění.

Abstract:

Short-chain acyl-CoA dehydrogenase deficiency (SCADD) belongs to autosomal recessive disorders of mitochondrial -oxidation. It is caused by mutations in the ACADS gene. The disease is accompained by a variety of clinical signs (eg. metabolic acidosis, devepmental delay, seizures), or patients may be completely asymptomatic. There is a growing need to introduce SCADD among the diseases that are being investigated in the neonatal screening of the Czech republic. In the practical part, target metabolomic analysis was used to find new biomarkers of the disease. Dry blood spots obtained from neonates with SCADD and controls were analysed by liquid chromatography coupled with tandem mass spektrometry. The data was processed and statisticaly evaluated. Changes were found in the levels of acylcarnitines (butyrylcarnitine, decanoylcarnitine, decenoylcarnitine), organic acids (ethylmalonate, betaine) and purines (inosine, hypoxanthine and IMP). Combination of these metabolites may lead to an increased selectivity of disease detection.

Klíčová slova

Beta-oxidace mastných kyselin, SCADD, hmotnostní spektrometrie, metabolomika, statistická analýza

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Radana Karlíková

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie