Detekce nukleových kyselin v agarózovém gelu s využitím fluorescenčních barviv ethidium bromid resp. SYBR Green.

Veronika JANKŮ

Bakalářská práce

Nucleic acids agarose gel detection using fluorescent stain ethidium bromide resp. SYBR Green.

Anotace:

Elektroforéza patří v biochemii a molekulární biologii k nejpoužívanějším separačním technikám při izolaci a analýze nukleových kyselin a proteinů. Problematikou elektroforézy nukleových kyselin se zaměřením na možné způsoby detekce těchto významných bioinformačních makromolekul se zabývá také tato bakalářská práce. Cílem bakalářské práce bylo zjistit výhody i nevýhody detekčních barviv ethidium bromid a SYBR Green používaných při elektroforéze DNA v agarózovém gelu. Ethidium bromid představuje levnější, ?léty prověřenou? ale z hlediska toxicity rizikovější variantu. SYBR Green, je ve srovnání s výše uvedeným barvivem dražší, avšak citlivější a prakticky netoxický. Z hlediska manipulace je ethidium bromid odolnější a stálejší. Časová náročnost detekce je v obou případech srovnatelná.

Abstract:

Electrophoresis is the most commonly used separation techniques for the isolation and analysis of nucleic acids and proteins in biochemistry and molecular biology. This thesis deals with the problems electrophoresis of nucleic acids with a focus the possible ways detect these important macromolecules bioinformatic. Aim of this bachelor thesis was to determine the advantages and disadvantages of detection dyes ethidium bromide and SYBR Green used in DNA electrophoresis in agarose gel. Ethidium bromide is cheaper, "time-tested" but in terms of toxicity is risky option. SYBR Green is compared with the above dye expensive, but more sensitive and practically non-toxic. In terms of manipulation ethidium bromide is more durable and stable. Duration of detection in both cases is comparable.

Klíčová slova

gelová elektroforéza DNA, ethidium bromid, SYBR Green

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 22. 4. 2013

Zveřejnit od: 22. 4. 2013

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Michal Haluzík, Ph.D.

OSTRAVSKÁ UNIVERZITA V OSTRAVĚ

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Chemie / Chemie