Identifikace parentálních genomů morfologicky kryptických druhů slepýšů (Anguis colchica a A. fragilis) muktilokusovým studiem jaderné DNA

Bc. Vojtěch BONCZEK

Master's thesis

Identification of parental genomes in morphologically cryptic slow worms (Anguis colchica and A. fragilis) using multilocus study of nuclear DNA

Abstract:

Hybridní zóny představují zcela unikátní možnost, jak studovat speciační procesy v reálném čase. Dnešní metody založené na poznatcích molekulární biologie vyžadují použití genetických markerů, které dokáží přinést odpovědi na naše otázky týkající se fylogeografie, nebo demografie studovaných druhů. Nejinak je tomu i u představitelů čeledi Anguidae, kteří skrývají ohromnou genetickou variabilitu, která se teprve nedávno promítla do jejich taxonomie. Hlavním cílem práce bylo navrhnout set restrikčních endonukleáz pro čtyři jaderné a jeden mitochondriální gen, které byly vyhodnoceny jako diagnostické pro dva druhy slepýšů (A. fragilis a A. colchica). PCR-RFLP metoda umožní rychlou identifikaci obou druhů a značně zjednoduší indentifikaci průběhu evropské hybridní zóny mezi nimi.

Abstract:

Hybrid zones represent a completely unique opportunity to study speciation processes in real time. Today's methods based on the knowledge of molecular biology require the use of genetic markers that can provide answers to our questions about phylogeography or demography of the studied species. It is no different with the representatives of the Anguidae family, who hide a huge genetic variability that has only recently been reflected in their taxonomy. The main goal of this work was to design a set of restriction endonucleases for four nuclear and one mitochondrial gene, which were selected as diagnostic for two species of slow worms (A. fragilis and A. colchica). The PCR-RFLP method will allow rapid identification of both species and will greatly simplify the identification of the course the European hybrid zone between the two species.

Keywords

Hybridní zóna, Fylogeografie, Anguis, Pseudopus, jaderný DNA marker, mitochndriální DNA marker, PCR, restrikční enzymy, štěpení DNA

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 23. 4. 2020

Accessible from:: 31. 12. 2999

Thesis defence

• Date of defence: 24. 8. 2020
• Supervisor: RNDr. Lukáš Choleva, Ph.D.

University of Ostrava

Faculty of Science

Master programme / field:
Biology / Systematic Biology and Ecology