Testování inhibitorů metyltransferázy pomocí počítačových simulací – Bc. Martin Babáš
Bc. Martin Babáš
Diplomová práce
Testování inhibitorů metyltransferázy pomocí počítačových simulací
Testing of methyltranferase inhibitors using computer simulations
Anotace:
Předložená diplomová práce se zaobírá testováním inhibitorů methyltransferázy DOT1L. DOT1L se podílí na regulaci genové exprese, jejíž narušení může mít pro organismus závažné následky. V případě MLL typu rakoviny představuje aberantní nábor DOT1L enzymu zásadní krok pro rozvoj leukémie. Inhibitor DOT1L vyvíjený spolupracující výzkumnou skupinou a jeho modifikované verze byly v rámci této práce testovány …víceAbstract:
This diploma thesis is focused on methyltransferase DOT1L inhibitors testing. DOT1L plays an important role during the gene expression regulation and its disruption can have a serious impact on the organism. In case of MML type cancer the aberrant recruitment of DOT1L enzyme is a key step for the leukaemia development. The inhibitor and its modified versions, synthetized by cooperating research group …víceKlíčová slova
výpočetní chemie molekulová mechanika výpočty volných energií termodynamická integrace methyltransferázy optimalizace struktury inhibitoru DOT1L computational chemistry molecular mechanics free energy calculations thermodynamic integration methyltransferases inhibitor structure optimisation
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 17. 6. 2020
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/vy6qh/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 29. 6. 2020
- Vedoucí: RNDr. Mgr. Arnošt Mládek, Ph.D.
- Oponent: Mgr. Iva Procházková, Ph.D., Mgr. Naděžda Špačková, Ph.D.
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaMagisterský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie
Práce na příbuzné téma
-
Free Energy Calculations as a Tool of Supramolecular and Biomolecular Chemistry
Zora Střelcová -
Molekulová dynamika a výpočty volných energii mono a di-nukleotidových analogů s potenciálním antibiotickým účinkem
Hana Zigová -
Výpočty volných energií konformačních změn vybraných fragmentů nukleových kyselin
Barbora Benešová -
Použití metod pro výpočet volných energií k studiu biomolekulárních procesů
Ivo Kabelka -
Nové metody výpočtů volných energií pro studium interakcí protein-ligand
Daniela Toulcová -
Výpočet interakční energie amfifilních peptidů
Daniel Jaroň -
Výpočet väzobného profilu volnej energie formovania proteínových dimérov.
Ján Tungli -
Stanovení volné povrchové energie vybraných pevných látek metodou sedící kapky
Hynek Ondráček