Nástroje pro analýzu trajektorií molekulárně dynamických simulací – Bc. Viktor Illík
Bc. Viktor Illík
Bakalářská práce
Nástroje pro analýzu trajektorií molekulárně dynamických simulací
Tools for Analaysis of Molecular Dynamics Trajectories
Abstract:
This thesis is focused on implementation of new tools for analysis of trajectories of MD simulations using package of CATs programs. This study was carried out with an emphasis on calculations and analysis of molecular surfaces SASA and SESA and histogram statistics.Abstract:
Táto bakalárska práca je zameraná na vývoj nových nástrojov na analýzu trajektórií MD simulácií balíkom programov CATs. V práci bol kladený dôraz na výpočet a analýzu molekulových povrchov SASA a SESA a na histogramovú štatistiku.Klíčová slova
molekulární povrch MSMS SASA SESA nukleové kyseliny nukleotid molekulové modelování molekulová dynamika Amber trajektorie CATs histogram JavaScript C++ molekulový povrch molekulové modelovanie trajektória molecular surface nucleic acids nucleotide molecular modelling molecular dynamics trajectory
Jazyk práce: slovenština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 12. 5. 2016
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/sg7wt/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 15. 6. 2016
- Vedoucí: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaBakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Chemoinformatika a bioinformatika
Práce na příbuzné téma
-
Modelovanie isoforiem Na+/K+ - ATPasy
Jana MACÚCHOVÁ -
Strukturní dynamika biomolekulárních komplexů
Pavlína Pokorná -
Strukturní analýza proteinů 14-3-3 s využitím molekulové dynamiky.
Hana Zigová -
Studium komplexů proteinů metodami molekulového modelování
Veronika Lásková -
Studium interakcí MAGE proteinů metodami molekulového modelování
Pavel Janoš -
Studium vztahů mezi přístupovými cestami a aktivitou enzymů metodami molekulového modelování
Ondřej Vávra -
Studium reakčního mechanismu bakteriální glykosyltransferázy pomocí molekulového modelování
Július Zemaník -
Studium konformačního chování amyloidu beta a jeho mutantů v pozici 35 metodami molekulového modelování
Libuše Dvořáková