Genetická studie lidí z jižního předhradí Břeclav - Pohansko

Mgr. Kateřina Boberová, Ph.D.

Doctoral thesis

Genetic study of people from south outer precinct Břeclav - Pohansko

Abstract:

Předložená disertační práce se zabývá využitím molekulárně-genetických metod pro determinaci pohlaví z kosterního materiálu. Využití molekulárně-genetických analýz v antropologii je přínosné zejména při určování pohlaví u dětských kosterních pozůstatků, kosterních pozůstatků nekompletních (především bez zachovalé lebky a pánve) a také kosterních pozůstatků fragmentárních. V těchto případech je určování pohlaví tradičními morfoskopickými a morfometrickými metodami značně problematické a často nemožné. Aplikace molekulárně-genetických metod je tedy vhodným přístupem pro získání nových údajů o historických populacích. V disertační práci jsem určovala pohlaví u dětských, nedospělých a neurčitelných kosterních pozůstatků z archeologické lokality jižní předhradí na Pohansku u Břeclavi. Ve většině případů se jedná o kosterní nálezy velice špatně zachovalé a fragmentární. Pohlaví bylo určováno na základě dvou vybraných pohlavních markerů, SRY genu a genu pro amelogenin. SRY gen je lokalizován na chromozomu Y a je specifický pro jedince mužského pohlaví. V případě pozitivního signálu po amplifikaci PCR je stanoveno pohlaví mužské. Gen pro amelogenin se nachází na obou pohlavních chromozomech. Na základě delece popsané na X chromozomu v genu pro amelogenin lze rozlišit mužský a ženský genotyp, neboť amplifikační produkty z X a Y chromozomu se liší svou délkou. Pro genetické určení pohlaví byly odebrány vzorky z celkem 120 koster z jižního předhradí. Na základě shody výsledků obou použitých metod se podařilo determinovat pohlaví u 66 jedinců, 31 mužů a 35 žen. Díky aplikaci molekulárně-genetických metod bylo určeno pohlaví u více než poloviny analyzovaných vzorků a mohla tak být doplněna a zpřesněna demografická data populace z jižního předhradí na Pohansku.

Abstract:

The presented thesis is focused on the use of molecular-genetic methods for sex determination from skeletal material. Application of molecular-genetic analysis in anthropology is useful especially in sex determination of skeletal remains of children, incomplete skeletal remains (in cases where the skull or pelvis is missing) and fragmentary skeletal remains. The traditional anthropological approach is limited in such cases, and genetic methods can become a suitable alternative. Sex typing genetic markers (SRY, amelogenin) were used for sex determination of children, subadults and undetermined fragmentary skeletal remains from the burial site Pohansko near Břeclav, south outer precincts. The bones were in very poor condition, fragmented, and in most cases unidentifiable. The SRY gene is located on the short arm of the Y chromosome and is specific for male individuals. If a positive signal is detected after PCR amplification, the male sex is determined. The amelogenin gene lies both on the X and Y chromosomes in humans. Using specific amelogenin PCR primers, different bp-length fragments are amplifiable from the X and Y chromosomes, respectively. The most widely used primer set delimits a deletion on the X chromosome. Using this method, males and females can be differentiated based on a length dimorphism of PCR products for the X and Y chromosomes. Altogether, 120 samples of skeletal remains from the south outer precincts were analysed for sex determination. Using the two sex typing markers, sex was determined in 66 samples, 31 male and 35 female. Only the concordant results of both sex markers were considered as valid. Sex was genetically determined in more than half of the investigated cases. The results of this study allowed the demographic profile of the Pohansko population to be completed with more accurate knowledge about the mortality of this population.

Keywords

aDNA, amelogenin, demografie, jižní předhradí, kosterní pozůstatky, PCR, Pohansko, určení pohlaví, SRY aDNA, demography, south outer precinct, skeletal remains, sex determination, SRY

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 28. 6. 2012

Thesis defence

• Date of defence: 3. 9. 2012
• Supervisor: doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.
• Reader: doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc., doc. RNDr. Mária Vondráková, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Doctoral programme / field:
Biology (4-years) / Anthropology