Bc. Jana Horáčková
Master's thesis
Predikce stabilních proteinů
Prediction of stable proteins
Abstract:
Tato diplomová práce se zabývá hodnocením stability proteinů na základě in silico predikcí. Hlavní důraz byl kladen na testování výpočetního nástroje Rosetta, který se používá pro výpočet rozdílu volné energie u mutovaných proteinů. Cílem bylo najít jeho optimální nastavení pro použití v rámci webového serveru FireProt. Dále byl otestován alternativní přístup k predikci stability kombinující molekulovou …moreAbstract:
This thesis is focused on protein stability prediction by in silico tools. The main goal was to evaluate the computational tool Rosetta, which is used for the prediction of folding free energy upon mutation. The goal was to find the optimal settings of Rosetta to be used in the FireProt web server workflow. Furthermore, a novel approach for stability prediction was tested, combining molecular dynamics …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 10. 6. 2021
Identifier:
https://is.muni.cz/th/bscl9/
Thesis defence
- Date of defence: 8. 7. 2021
- Supervisor: Mgr. David Bednář, Ph.D.
- Reader: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Biochemistry / Bioinformatics
Theses on a related topic
-
Study of thermodynamic, kinetic and analytical properties of tetraazamacrocyclic ligand derivatives
Jakub Vaněk -
Studium termodynamického chování a termické stability pokročilých termoelektrických materiálů
František Zelenka -
Termodynamická analýza DNA po její modifikaci protinádorově účinnými látkami
Jakub Florián -
Predicting supramolecular Interactions and Properties of Systems by Methods of Computational Chemistry
Matúš Durec -
IT služby v procesu adaptace zaměstnanců: Design průvodce pro nové zaměstnance Masarykovy univerzity
Jan Valtr -
Teorie architektury a designu v digitálním věku: teoretická revize myšlení o digitálně zprostředkované architektuře a designu
Ondřej Staněk -
Česká rodina a vztahy mezi G1-G3
Marie Lukášová -
G+G. Aneb společná cesta gymnastiky a grafiky.
Markéta Dufková