Význam mikroRNA v molekulární patologii nádorů slinivky břišní

Mgr. Soňa Klusová

Bakalářská práce

Significance of microRNAs in molecular pathology of pancreatic cancer

Anotace:

Abstrakt Východisko: Nádory slinivky břišní jsou charakteristické vysokou agresivitou a mortalitou. Většina případů je zjištěna až v pozdním stádiu metastázování, čímž se vyhlídky na úspěšnou léčbu zcela ztrácejí. Včasná diagnostika a zlepšení prognózy pacientů zůstávají velkou výzvou do budoucna. Cíl práce: Cílem této práce je porovnání exprese pěti mikroRNA ve zdravých a nádorových tkáních, konkrétně miR-21, miR-181a, miR-203, miR-217 a miR-222. Práce je dále zaměřena na hledání nového biomarkeru, který by pomohl odlišit nádory slinivky břišní od chronické pankreatitidy. Metody: Hladiny jednotlivých mikroRNA byly analyzovány pomocí kvantitativní PCR v reálném čase. Jako nejvhodnější endogenní kontrola pro normalizaci dat byla identifikována RNU48. Vyhodnocení dat bylo provedeno pomocí softwaru GraphPad Prism s využitím Mann-Whitneyho testu, Kruskal-Wallisova testu, ROC analýzy a Kaplan-Meierovy analýzy. Výsledky: Výledky nám potvrdily funkci miR-217 jako nádorového supresoru a zároveň potenciálního biomarkeru pro odlišení chronické pankreatitidy od nádorů slinivky břišní. Souvislost mezi celkovým přežíváním a hladinou miR-217 nebyla prokázána. Ostatní mikroRNA se v nádorových tkáních nacházely ve zvýšené míře, což poukazuje na jejich onkogenní funkci. Závěr: Nádorově supresorová miR-217 je rozdílně exprimovaná ve zdravé sliznici, v tkáních chronické pankreatitidy a v nádorových buňkách. Tímto miR-217 potvrdila svou funkci potenciálního biomarkeru odlišujícího tyto dvě diagnózy. Avšak přesné funkce a cílové struktury této mikroRNA nejsou doposud zcela jasné, proto je bude potřeba ověřit pomocí in vitro analýz.

Abstract:

Abstract: Background: Pancreatic tumours are characterized by their aggressiveness and high mortality rate. Majority of the cases are detected in their late stages with metastasis, thus the chance of successful treatment is completely lost. Early diagnosis and prognosis improvement are still a great future challenge. Purpose: The aim of this thesis is to compare the expression of five microRNAs in normal and tumour tissues, specifically miR-21, miR-181a, miR-203, miR-217 and miR-222. The study is also focused on analysis of markers which could distinguish pancreatic tumours from chronic pancreatitis. Methods: We assessed the levels of particular microRNAs using quantitative real-time PCR. RNU48 was selected as the most appropriate endogenous control for data normalization. Data evaluation was performed by software GraphPad Prism using Mann-Whitney test, Kruskal-Wallis test, ROC analysis and Kaplan-Meier analysis. Results: Our results demonstrated a function of miR-217 as a tumor suppressor and also as a potential biomarker of chronic pancreatitis. The relationship has not been observed between overall survival and the level of miR-217. The other microRNAs were proved to function as oncogenes because of their increased levels in tumour tissues. Conclusion: Tumour suppressor miR-217 was found to be differentially expressed in normal pancreas, chronic pancreatitis and cancerous tissues. Thus, miR-217 was confirmed to be a potential marker discriminating these two diagnoses. However, function and seed region of this microRNA is still not clear, therefore, it will be necessary to explore them by using in vitro analysis.

Klíčová slova

nádory slinivky břišní, mikroRNA, qRT-PCR pancreatic tumours, microRNA, qRT-PCR

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2013

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 19. 6. 2013
• Vedoucí: Mgr. Petra Vychytilová, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie