Back to search

Eva Klimentová

Bachelor's thesis

Pipeline for analysis and visualization of double-strand breaks reparation

Pipeline for analysis and visualization of double-strand breaks reparation
Abstract:
Tato práce se zabývá vytvořením jednoduchého a srozumitelného nástroje pro analýzu NGS dat s opraveným dvoubodovým zlomem, který může být použit i uživateli bez hlubších znalostí informatiky. Vytvořený výpočetní nástroj umožňuje uživateli analyzovat a přehledně zobrazit zpracovaná vstupní data. Pro vytvoření nástroje byly použity vlastní scripty společně s již existujícím softwarem. Výsledný nástroj …more
Abstract:
This thesis deals with creating a comprehensive and easy to use tool, which can be used by users non familiar with informatics to analyse NGS data with repaired double-strand break. The created tool – a computational pipeline – enables users to analyze and clearly visualize processed input data. To build the pipeline, various existing software tools were used together with custom implemented scripts …more
 

Keywords

double-strand break reparation NGS Ku protein bioinformatics pipeline
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 20. 7. 2020
Identifier: https://is.muni.cz/th/r541v/

Thesis defence

  • Date of defence: 21. 9. 2020
  • Supervisor: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
  • Reader: doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D.

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky
Složka Reference to the local database directory of the institution

Masaryk University

Faculty of Informatics

Bachelor programme / field:
Applied Informatics / Bioinformatics

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.