Data Management Utilities for the Empaia Infrastructure – Ing. Ganna Starovoytova
Ing. Ganna Starovoytova
Bachelor's thesis
Data Management Utilities for the Empaia Infrastructure
Data Management Utilities for the Empaia Infrastructure
Abstract:
Práce se zabývá rozšířením implementace architektury mikroslužeb Empaia pro digitální patologii, kterou využívá výzkumná skupina RationAI. Empaia nabízí referenční implementaci spolu se standardem pro AI aplikace v digitální patologii. Chybí jí však flexibilní nástroj pro import digitálních scanů a metadat. První část této práce zahrnuje implementaci nástroje příkazové řádky pro import slidů a klinických …moreAbstract:
This thesis addresses gaps identified in the Empaia Whole Slide Imaging (WSI) reference architecture implementation, which the RationAI research group utilizes. Empaia provides a robust platform with authorization and support for multiple WSI formats and a standard for AI applications in digital pathology. However, it lacks a flexible slide-importing tool. The first part of this work involves the development …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 23. 5. 2024
Identifier:
https://is.muni.cz/th/lsk5b/
Thesis defence
- Date of defence: 26. 6. 2024
- Supervisor: Mgr. Jiří Horák
- Reader: RNDr. Vít Rusňák, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsBachelor programme / field:
Programming and development / Programming and development
Theses on a related topic
-
Analysis of Whole Slide Imaging Anonymity
Jan Čech -
Whole slide image viewer for pathological data
Jiří Horák -
Aplikácia virtuálneho mikroskopu pre patologické obrazy
Matej Stano -
Empaia-compliant WSI Case Viewer for xOpat
Adam Bujdák -
Implementation of JPEG2000 Support for RatioViz Visualization System
Jiří Buchta