GPU akcelerace spojitého zpřesňování natočení obrázků v Xmipp – Bc. Martin Pernica
Bc. Martin Pernica
Master's thesis
GPU akcelerace spojitého zpřesňování natočení obrázků v Xmipp
GPU acceleration of the continuous refinement of the alignment parameters in Xmipp
Abstract:
Cílem této práce bylo zrychlení programu z balíčku Xmipp. Jde o výpočet spojitého zpřesňování natočení obrázků vzhledem k prostorovému modelu biomolekuly ve Fourierově prostoru. Ve srovnání s paralelní CPU implementací se podařilo dosáhnout 9,3násobného zrychlení za použití GPU akcelerace. Akcelerovaná verze bude integrována do balíčku Xmipp.Abstract:
The goal of this thesis was to accelerate program from Xmipp bundle, which continuously refines angles of images with respect to 3D model of a biomolecule. In comparison to original parallel CPU version the GPU accelerated version achieved 9,3 times speedup. Accelerated version will be integrated to Xmipp bundle.
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 21. 5. 2024
Identifier:
https://is.muni.cz/th/bkn86/
Thesis defence
- Date of defence: 18. 6. 2024
- Supervisor: doc. RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D.
- Reader: Mgr. Aleš Křenek, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsMaster programme / field:
Artificial intelligence and data processing / Big data