Bc. Martin Pernica

Master's thesis

GPU akcelerace spojitého zpřesňování natočení obrázků v Xmipp

GPU acceleration of the continuous refinement of the alignment parameters in Xmipp
Anotácia:
Cílem této práce bylo zrychlení programu z balíčku Xmipp. Jde o výpočet spojitého zpřesňování natočení obrázků vzhledem k prostorovému modelu biomolekuly ve Fourierově prostoru. Ve srovnání s paralelní CPU implementací se podařilo dosáhnout 9,3násobného zrychlení za použití GPU akcelerace. Akcelerovaná verze bude integrována do balíčku Xmipp.
Abstract:
The goal of this thesis was to accelerate program from Xmipp bundle, which continuously refines angles of images with respect to 3D model of a biomolecule. In comparison to original parallel CPU version the GPU accelerated version achieved 9,3 times speedup. Accelerated version will be integrated to Xmipp bundle.
 

Kľúčové slová

CUDA GPU akcelerace Xmipp kryoelektronová mikroskopie
 
Jazyk práce: Czech
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 5. 2024
Identifikátor: https://is.muni.cz/th/bkn86/

Obhajoba závěrečné práce

  • Obhajoba proběhla 18. 6. 2024
  • Vedúci: doc. RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D.
  • Oponent: Mgr. Aleš Křenek, Ph.D.

Citační záznam

Citovat tuto práci

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky
Složka Odkaz na adresář do lokálního úložiště instituce

Masaryk University

Faculty of Informatics

Master programme / odbor:
Artificial intelligence and data processing / Big data

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.