Vyhledávání lektinů v klíštěti pomocí bioinformatických metod

Bc. Kateřina Bezděková

Bakalářská práce

Searching for lectins in ticks using bioinformatics

Anotace:

Lektiny jsou významnou skupinou glykoproteinů neimunitního původu, které jsou schopny specificky a reverzibilně vázat monosacharidy a oligosacharidy. Díky této schopnosti hrají důležitou roli v obranných mechanismech vrozené imunity obratlovců i bezobratlých. Tato práce se zabývá vyhledáváním lektinů pomocí bioinformatických metod v transkriptomu klíštěte Ixodes ricinus. Na základě sekvenční homologie bylo identifikováno 16 hypotetických proteinů podobných již známým lektinům. Některým takto nalezeným potenciálním lektinům byly dále predikovány jejich vlastností a terciární struktura.

Abstract:

Lectins are an important group of glycoproteins of non-immune origin which are able to recognize and reversibly bind monosaccharides and oligosaccharides. Because of this ability, they play a significant role in innate immunity defense mechanisms of vertebrates and invertebrates. This thesis deals with searching for lectins in the transcriptome of tick Ixodes ricinus using bioinformatics. Based on sequence homology, there were identified 16 hypothetical proteins similar to already known lectins. Some of these potential lectins were further analyzed by predicting their properties and tercial structure.

Klíčová slova

lektin, klíště, Ixodes ricinus, imunita, lectin, tick, immunity

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2017
• Vedoucí: Mgr. Lenka Malinovská, Ph.D., prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Chemoinformatika a bioinformatika