Zpět na vyhledávání

Markus PROMBERGER

Bachelor's thesis

Auto-Encoding Amino Acid Sequences with LSTM

Auto-Encoding Amino Acid Sequences with LSTM
Abstract:
In this thesis a sequence to sequence autoencoder for amino acid sequences is constructed. The latent representation of the autoencoder is then used to classify the amino acid sequences according to their animal kingdom. The data consists of sequences from three different kingdoms, mammals, fish and birds. The thesis includes the preprocessing necessary for the data, the construction of the sequence …more
Abstract:
In this thesis a sequence to sequence autoencoder for amino acid sequences is constructed. The latent representation of the autoencoder is then used to classify the amino acid sequences according to their animal kingdom. The data consists of sequences from three different kingdoms, mammals, fish and birds. The thesis includes the preprocessing necessary for the data, the construction of the sequence …more
 

Keywords

machine learning sequence to sequence autoencoder amino acid sequence bioinformatic sequence alignment clustering
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 8. 3. 2022

Thesis defence

  • Supervisor: prof. Dr. Sepp Hochreiter

Citation record

Cite this text
The right form of listing the thesis as a source quoted

PROMBERGER, Markus. Auto-Encoding Amino Acid Sequences with LSTM. České Budějovice, 2022. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakulta
http://wstag.jcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=61194 Reference to the local database file of the institution
 
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights
Theses blj2u9 blj2u9/2
10/3/2022
Folders
Files
thesis Promberger_Markus_2022_BT.pdf
Bulánová, L.
11/3/2022

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.