Genetická analýza výskytu letní vyrážky u starokladrubského koně

Bc. Agáta Čermáková

Master's thesis

Genetic analysis of the occurrence of insect bite hypersensitivity in the Old Kladruby horse

Abstract:

Letní vyrážka je nejčastěji vyskytující se onemocnění, které postihuje koně všech kategorií po celém světě. Projevuje se silným svěděním, které nutí koně drbat si postižená místa až do krve. Toto svědění způsobuje protisrážlivá látka, která je obsažena ve slinách pakomárků rodu Culicoides spp. a muchniček rodu Simulium sp. Onemocnění je ovlivněno genetickými a enviromentálními faktory. Cílem této práce bylo odhadnout genetické parametry a efekty prostředí ovlivňující výskyt letní vyrážky u bílé varianty starokladrubského koně. Záznamy o výskytu letní vyrážky byly poskytnuty národním hřebčínem Kladruby nad Labem a od soukromých chovatelů. Data obsahovala 1 368 pozorování u 558 jedinců. Hodnocení probíhalo mezi roky 1997 a 2009, zahrnuti byli hřebci a klisny. Data byla upravena pomocí softwaru SAS. Pro odhad genetických faktorů a efektů prostředí byla použita metoda GLM. Genetické parametry byly odhadnuty pomocí metody REML v programu Remlf90. Po všech úpravách zůstalo v databázi 515 jedinců, z toho bylo 146 trpících letní vyrážkou a 369 zdravých. Z celkové variability bylo fixními efekty vysvětleno 12,27 % (rok hodnocení), 10,03 % (rok narození), 4,67 % (věk jedince). Koeficient determinace vyšel na 33,62 %. Koeficient dědivosti byl odhadnut na 0,12. Letní vyrážka byla tedy u starokladrubského koně odhadnuta jako nízce dědivé onemocnění. Koeficient opakovatelnosti byl odhadnut na 0,71. Prevalenci letní vyrážky u tohoto plemene by bylo možné snížit přísnějším vyřazováním postižených koní z chovu. Měla by být nulová tolerance pro výskyt letní vyrážky u plemenných hřebců. Na vznik onemocnění má také velký vliv prostředí národního hřebčína. V okolí se vyskytují stojaté vody, které jsou ideálním místem pro rozmnožování pakomárků.

Abstract:

Insect bite hypersensitivity is the most common disease that affects horses of all categories around the world. It is manifested by a strong itching, which forces the horse to scratch the affected areas into the blood. This itching is caused by an anticoagulant that is found in the saliva of midges of the genus Culicoides spp. and flies of the genus Simulium sp. The disease is affected by genetic and environmental factors. The aim of this study was to estimate the genetic parameters and environmental effects affecting the occurrence of insect bite hypersensitivity in a white variant of the Old Kladruber horse. Records of the occurrence of insect bite hypersensitivity were provided by the Kladruby nad Labem National Stud Farm and from private breeders. The data contained 1,368 observations from 558 individuals. The evaluation took place between 1997 and 2009 and included stallions and mares. The data was modified using SAS software. The GLM method was used to estimate genetic factors and environmental effects. Genetic parameters were estimated using the REML method in the Remlf90 program. After all the modifications, 515 individuals remained in the database, of which 146 suffered from insect bite hypersensitivity and 369 were healthy. Of the total variability, 12.27 % (year of evaluation), 10.03 % (year of birth), 4.67 % (age of the individual) were explained by fixed effects. The coefficient of determination came to 33.62 %. Heritability Coefficient was estimated at 0.12. The insect bite hypersensitivity was therefore estimated in the Old Kladruber horse to be a low hereditary disease. The repeatability coefficient was estimated at 0.71. The prevalence of insect bite hypersensitivity in this breed could be reduced by stricter exclusion of affected horses from breeding. There should be zero tolerance for insect bite hypersensitivity in breeding stallions. The environment of the National Stud Farm also has a great influence on the occurrence of the disease. The surrounding area has standing water, which is an ideal breeding ground for midges.

Keywords

prostřeďové efekty, plemenná hodnota, koeficient dědivosti

Keywords

heritability coefficient, breeding value, environmental effects

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 13. 4. 2022

Thesis defence

• Supervisor: prof. Ing. Luboš Vostrý, Ph.D.

Czech University of Life Sciences Prague

Faculty of Agrobiology, Food and Natural Resources

Master programme / specializace:
Biotechnology / Biotechnology and Animal Breeding