Variabilita a cytogenetické vlastnosti oblastí ribozomálních genů v genomech vybraných druhů ryb

Mgr. Eva Hnátková

Disertační práce

Variability and cytogenetic characteristics of ribosomal gene clusters in genomes of selected fish species

Anotace:

Byly studovány a analyzovány karyotypy a další chromozómové charakteristiky, zejména fenotypy NORů (organizátorů jadérka), u druhů vzácných, endemických, případně obtížně ulovitelných – Cobitis strumicae, Sabanejewia bulgarica, Ellopostoma mystax (Cobitidae, Ellopostomatidae – Cypriniformes), Silurus aristotelis, S. glanis (Siluridae - Siluriformes), a to užitím konvenčních postupů (C-pruhování, impregnace stříbrem, CMA3 fluorescence) a/nebo postupů molekulárních (FISH rDNA sondou). Výsledky ukazují, že tři studované druhy mají jednoduché fenotypy NORů (tj. místa hlavních ribozomálních genů) na jednom páru chromozómů, s výjimkou E. mystax, kde bylo nalezeno šest párů chromozómů nesoucích tyto oblasti. Rovněž cytogenetické vlastnosti, tj. shodná lokalizace pozitivních signálů po barvení Ag a fluorescenci CMA3, pozorované v karyotypech studovaných druhů odpovídají poměrům u většiny ostatních kostnatých ryb. Tyto výsledky byly zpracovány do tří publikovaných prací a jednoho rukopisu zaslaného k recenzi.

Abstract:

Karyotypes and other chromosomal characteristics, especially NOR phenotypes, in rare, endemic or rarely collected, namely – Cobitis strumicae, Sabanejewia bulgarica, Ellopostoma mystax (Cobitidae, Ellopostomatidae - Cypriniformes), Silurus aristotelis, S. glanis (Siluridae - Siluriformes) were examined using conventional (C-banding, Ag-impregnation, CMA3 fluorescence) and/or molecular (rDNA FISH) protocols. Our results demonstrated that three species exhibited simple NOR phenotypes, i.e. these on single chromosome pair, while six pairs bearing these sites were observed in E. mystax. The correspondence between positive Ag- and CMA3 signals in karyotypes of species under study equals that found in other teleostean fishes. Three published papers and one manuscript submitted for revision resulted from our studies.

Klíčová slova

cytotaxonomie ryb, fenotypy NOR, Otophysi

Keywords

fish cytotaxonomy, NOR phenotypes, Otophysi

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 3. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: prof. Ing. Lukáš Kalous, Ph.D.
• Oponent: Marta špakulová, externi, Alexandr Sember, externi, Martin Flajšhans, externi

Česká zemědělská univerzita v Praze

Fakulta agrobiologie, potravinových a přírodních zdrojů

Doktorský studijní program:
Aplikovaná zoologie