Studium nekovalentních interakcí protein-ligand pomocí hmotnostní spektrometrie

Bc. Petra ZAPLETALOVÁ

Diplomová práce

The study of non-covalent interactions of protein-ligand by mass spectrometry

Anotace:

Předložená diplomová práce se věnuje studiu interakcí proteinů s ligandy pomocí hmotnostní spektrometrie. V teoretické části je zpracována literární rešerše na téma hmotnostní spektrometrie a protein-ligandových interakcí. Experimentální část práce se zabývá stanovením optimálního koncentračního rozsahu cytochromu c a hovězího sérového albuminu a následně měřením interakcí obou proteinů s ligandy. Pro měření byly použity dva hmotnostní spektrometry ESI/QqTOF a MALDI-TOF. Jako ligandy byly zvoleny Triterpen, karboran, tryptofan a cisplatina. Vyvinutá metoda byla použita ke studiu interakce avidinu s modifikovaným biotinem.

Abstract:

The thesis is devoted to the study of interactions between proteins and ligands using mass spectrometry. The theoretical part includes the literature review of mass spectrometry and protein-ligand interactions. The experimental part deals with the determination of the optimum concentration range of cytochrome c and bovine serum albumin and analysis of the interaction of above mentioned proteins with ligands. Two mass spectrometers ESI/QqTOF and MALDI-TOF were used in this analysis. Triterpene, carborane, tryptophan and cisplatin were chosen as ligands. Developed method was used for verification of interaction of avidin and modified biotin.

Klíčová slova

interakce protein-ligand, hmotnostní spektrometrie, proteomika

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 12. 5. 2016

Zveřejnit od: 12. 5. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Tomáš Oždian

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie