Fyziologické a genetické aspekty aktivity acidofilních bakterií oxidujících sirné látky

Mgr. Jiří Kučera, Ph.D.

Doctoral thesis

Physiological and genetic aspects of acidophilic sulfur-oxidizing bacteria activity

Abstract:

Disertační práce se zabývá studiem acidofilních bakterií důležitých v procesech (bio)oxidace sulfidových minerálů. V této studii byl použit modelový mikroorganismus Acidithiobacillus ferrooxidans a byla studována adaptace sirných kultur této bakterie na oxidaci železa(II) na úrovni transkripce a syntézy proteinů spolu se stanovením kinetických parametrů tohoto procesu. Dále byla zkoumána kinetika bakteriální adaptace na anaerobní oxidaci síry spojenou s redukcí železa(III). Anaerobní respirace byla u At. ferrooxidans dále analyzována na úrovni syntézy proteinů k objasnění mechanismu anaerobního procesu.

Abstract:

Dissertation deals with the study of acidophilic bacteria important in (bio) oxidation of sulfide minerals. In this research, a model microorganism Acidithiobacillus ferrooxidans was used and adaptation of sulfur-oxidizing culture to the ferrous iron oxidation was studied at the levels of transcription and protein synthesis together with the determination of the kinetic parameters of the process. Further, the kinetics of bacterial adaptation to anaerobic elemental sulfur oxidation coupled to ferric iron reduction was investigated. Anaerobic respiration in At. ferrooxidans was further analyzed at the level of protein synthesis to clarify mechanism of the anaerobic process.

Keywords

Acidithiobacillus ferrooxidans, anaerobióza, fenotypová změna, oxidace Fe(II), oxidace síry, proteomika, redukce Fe(III), transkriptomika, anaerobiosis, iron(II) oxidation, iron(III) reduction, phenotypic switching, proteomics, sulfur oxidation, transcriptomics

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 28. 6. 2013

Thesis defence

• Date of defence: 11. 9. 2013
• Supervisor: doc. Ing. Martin Mandl, CSc.
• Reader: prof. Ing. Tomáš Macek, CSc., prof. Mgr. Marek Šebela, Dr.

Masaryk University

Faculty of Science

Doctoral programme / field:
Biochemistry (4-years) / Biochemistry