Výpočty volných energií konformačních změn vybraných fragmentů nukleových kyselin – Bc. Barbora Benešová
Bc. Barbora Benešová
Master's thesis
Výpočty volných energií konformačních změn vybraných fragmentů nukleových kyselin
Conformational free energy calculations on selected fragments of nucleic acids
Abstract:
Změna volné energie je hnací silou jakýkoliv kinetických procesů, jako jsou chemické reakce. Interkalace, reakce kdy ligand, nejčastěji organická sloučenina, se váže mezi páry bazí DNA dvoušroubovice, vede k otevření páru bazí a to může způsobit několi změn v DNA struktuře a funkci. Výpočty volných energií jsou jednou z nejběžnějších úkolů výpočetní chemie. Důležitou a také nejvíce žádoucí částí volné …moreAbstract:
Free energy difference is the driving force of any kinetic processes, such as chemical reactions. Intercalation, reaction when ligand, usually organic compound, binds into bases of DNA double helix, cased base pair opening and it can cause several changes of DNA structure and functions. Calculations of free energy are one of the most common tasks of computa- tional chemistry. Important and also the …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 14. 5. 2012
Identifier:
https://is.muni.cz/th/kj4b9/
Thesis defence
- Date of defence: 7. 6. 2012
- Supervisor: Mgr. Zdeněk Kříž, Ph.D.
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
BENEŠOVÁ, Barbora. \textit{Výpočty volných energií konformačních změn vybraných fragmentů nukleových kyselin}. Online. Master's thesis. Brno: Masaryk University, Faculty of Science. 2012. Available from: https://theses.cz/id/cjx9qn/.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Biochemistry / Biochemistry
Theses on a related topic
-
Free Energy Calculations as a Tool of Supramolecular and Biomolecular Chemistry
Zora Střelcová -
Výpočet profilů Gibbsovy energie chemické reakce pomocí ab initio molekulové dynamiky kombinované s metodou Umbrella sampling
Pavel CHMELAŘ -
Výzkum Nekanonických Nukleových Kyselin Pomocí Simulací Molekulární Dynamiky
Zhengyue Zhang -
Molekulární mechanismy poškození a opravy DNA
Ivo Durník -
Charge calculation and Study of Electrostatic Interactions in Molecular Mechanics
Radka Svobodová-Vařeková -
Předpověď stability proteinů pomocí kombinace strojového učení a molekulové mechaniky
Elkhan Malmanov -
Studium stability uhlíkových teček metodami molekulové mechaniky
Michal LANGER -
Testing of IBM quantum computers with focus on Bell inequalities
Tomáš Terem