Systematické modelování a analýza interakční sítě Min proteinů v bakteriálních kmenech Escherichia coli

Tereza PUCHROVÁ

Bachelor's thesis

Systematic modelling and analysis of the interaction network in bacterial strains of Escherichia coli

Abstract:

Escherichia coli bacterium developed a remarkable self-regulatory mechanism that regulates the process of its division. Min system is a system of three proteins that play the main part in this process. These proteins together e ect the placement of division septum and prevent formation of unequal daughter cells by directing it to the centre of the cell. A simple deterministic model of the Min system dynamics was developed and validated with in vivo experiments. Understanding the system's dynamics is crucial for further use of its principles for regulation in cells.

Abstract:

Bakterie Escherichia coli si vyvinula pozoruhodn ý autoregula ční mechanismus, který reguluje proces její ho dělení . Min systém je syst ém t ří proteinů, kter é v tomto procesu hrají st ěžejní roli. Vzájemnou spoluprac í tyto proteiny ovliv ňují správnou volbu mí sta dělení a vyloučí tak nesymetrick é rozd ělení bu ňky tí m, že donutí bu ňku rozd ělit se p ř í mo uprost řed. Byl navr žen jednoduch ý deterministick ý model dynamick ého chov ání Min syst ému a porovn án s v ýsledky experiment ů in vivo. Spr ávn é pochopení skute čn ého chov ání tohoto syst ému je st ěžejní pro budouc í u žití jeho princip ů v bun ěčné regulaci.

Keywords

matematick e modelov an, shlukov a anal yza, regulace, bun e cn e d elen, E. coli, Min syst em

Language used: English

Date on which the thesis was submitted / produced: 17. 5. 2013

Accessible from:: 31. 12. 2999

Thesis defence

• Supervisor: Daniel Georgiev, PhD.

University of West Bohemia

Faculty of Applied Sciences

Bachelor programme / field:
Applied Sciences and Computer Engineering / Cybernetics and Control Engineering