Syntéza parametrů pro sigmoidální kinetické modely – Bc. Aleš Pejznoch
Bc. Aleš Pejznoch
Master's thesis
Syntéza parametrů pro sigmoidální kinetické modely
Parameter Synthesis for Sigmoid Kinetic Models
Anotácia:
Práce se zabývá refaktorizací nástroje pro syntézu parametrů PEPMC, který je součástí nástroje BioDiVinE 1.5 vyvíjeného v Laboratoři systémové biologie na Fakultě informatiky Masarykovy univerzity v Brně. Dále je vyhodnocena efektivnost a praktická použitelnost nástroje. Text nejprve popisuje teoretická východiska, která jsou důležitá pro pochopení této práce. V další kapitole je představen nástroj …viacAbstract:
The aim of this thesis is to refactor parameter synthesis tool PEPMC, which is a component of the tool BioDiVinE 1.5 developed as a part of a research at the Systems Biology Laboratory at the Faculty of Informatics of Masaryk University in Brno. In the next step is evaluated the efficiency and practical accessibility of the tool. First, the text describes theory, which is important for understanding …viacKľúčové slová
biologický model ověřování modelu syntéza parametrů lineární temporální logika Büchiho automat obyčejné diferenciální rovnice po částech multi-afinní ODR model kinetika Michaelis-Mentenové Hillova kinetika biologic model model checking parameter synthesis linear temporal logic Büchi automaton ordinary differential equations piecewise multi-affine ODE model Michaelis-Menten kinetics Hill equation
Jazyk práce: Czech
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 25. 5. 2015
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/r3s0e/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 22. 6. 2015
- Vedúci: RNDr. David Šafránek, Ph.D.
- Oponent: Mgr. Matej Klement
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsMaster programme / odbor:
Applied Informatics / Bioinformatics
Práce na příbuzné téma
-
Abstraction-Based Analysis of Continuous-Time Models in System Biology
Jana Dražanová -
Asymptotic Properties of Solutions of Functional Differential Equations
Jitka Vacková -
The Helmholtz mapping and its applications for second order ordinary differential equations
Radka MALÍKOVÁ -
Obyčejné diferenciální rovnice vyšších řádů a jejich numerická řešení
Tomáš Ondruf -
Obyčejné diferenciální rovnice ve slovních úlohách
Jana Zuzaňáková -
Aplikace Lieových grup na diferenciální rovnice
Věra Stanzelová -
Obyčejné diferenciální rovnice a jejich systémy v chemické kinetice
Johana Kolárová -
Aplikace okrajových úloh pro obyčejné diferenciální rovnice v inženýrství
Jakub Zapoměl