G-kvadruplexy v dráze krevní srážlivosti

Bc. Jitka DVOŘÁKOVÁ

Diplomová práce

G-quadruplexes in blood coagulation pathway

Anotace:

G-kvadruplexy jsou nekanonické, čtyřvláknové struktury DNA či RNA bohaté na guanin, představující důležité prvky v mnoha metabolických a biologických procesech. Cílem práce bylo analyzovat G-kvadruplex formující sekvence účastnící se dráhy krevní srážlivosti a provést jejich 3D modelování. Experimentální část se soustředila na ověření G-kvadruplexového potenciálu u vybrané sekvence genu vWF, s následnou specifikací G-kvadruplexové struktury pomocí metody cirkulárního dichroismu. Prostřednictvím gelové elektroforézy bylo zjištěno, že přítomnost močoviny či K+ iontů příliš neovlivňovala tvorbu G-kvadruplexových struktur. Tato práce může v blízké budoucnosti přispět k potenciálnímu terapeutickému uplatnění tykající se dráhy krevní srážlivosti se zacílením na G-kvadruplexní struktury či geny, které se v krevní srážlivosti uplatňují.

Abstract:

G-quadruplexes are non-canonical, four-stranded DNA or RNA structures rich in guanine, representing important elements in many metabolic and biological processes. The aim of this study was to analyze G-quadruplex-forming sequences involved in the coagulation cascade and perform their 3D modeling. The experimental part focused on verifying the G quadruplex potential of a selected vWF gene sequence, with subsequent specification of the G-quadruplex structure using circular dichroism. Gel electrophoresis showed that the presence of urea or K+ ions did not significantly affect the formation of G-quadruplex structures. This work may contribute to potential therapeutic applications related to the coagulation cascade targeting G-quadruplex structures or genes involved in coagulation.

Klíčová slova

G-kvadruplex, hemostáza, koagulační kaskáda, fibrinolýza, aptamery, elektroforéza, CD

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 24. 4. 2023

Zveřejnit od: 31. 12. 2999

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 17. 5. 2023
• Vedoucí: Mgr. Martin Bartas

OSTRAVSKÁ UNIVERZITA

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Biologie se zaměřením na ekologii a biodiverzitu