Bc. Ivo Durník
Bakalářská práce
Mechanické vlastnosti biomolekul
Mechanical Properties of Biomolecules
Anotace:
Bakalářská práce studuje mechanické vlastnosti DNA a jejich ovlivnění přítomností nekanonického páru bází, který se může ve struktuře objevit v důsledku chybné replikace DNA. Výsledky mohou být důležité pro pochopení mechanismu opravy DNA a v práci jsou vztahovány na mechanismus rozpoznání chyby lidským reparačním enzymem MutSα. Studium je provedeno za pomoci metod výpočetní chemie, a to molekulové …víceAbstract:
This bachelor thesis studies mechanical properties of DNA and how these properties are altered by non-canonical base pairs, which can occur in the structure by erroneous replication of DNA. Results might be important for understanding of mechanism of DNA repair machinery and in this work they are related to mismatch recognition by human form of the MutSα enzyme. The study employs computational chemistry …víceKlíčová slova
postreplikativní reparace DNA MMR MutSα ohyb DNA párování bází výpočetní chemie molekulová mechanika molekulová dynamika kolektivní proměnná US WHAM ABF postreplicative mismatch repair DNA bending base pairing computational chemistry molecular mechanics molecular dynamics colective variable
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 5. 2016
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/iupnz/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 15. 6. 2016
- Vedoucí: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaBakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Chemoinformatika a bioinformatika
Práce na příbuzné téma
-
From Theory to Experiment: A Computational Chemistry Perspective on Dative Bond and Non-Covalent Interactions
Maximilián LAMANEC -
Reaction Mechanisms in on-Surface Synthesis by Computational Chemistry Methods
Adam MATĚJ -
Free Energy Calculations as a Tool of Supramolecular and Biomolecular Chemistry
Zora Střelcová -
Charge calculation and Study of Electrostatic Interactions in Molecular Mechanics
Radka Svobodová-Vařeková -
Předpověď stability proteinů pomocí kombinace strojového učení a molekulové mechaniky
Elkhan Malmanov -
Studium stability uhlíkových teček metodami molekulové mechaniky
Michal LANGER -
Molekulární mechanismy poškození a opravy DNA
Ivo Durník -
Parametry silového pole pro komplexy přechodných kovů: Supramolekulární vazebná afinita
Ivo Durník