Cílená a necílená metabolomická analýza krevní plazmy transgenních potkanů s tauopatií

Lenka KOCUROVÁ

Bakalářská práce

Targeted and untargeted metabolomic analysis of plasma samples from transgenic rats with tauopathy

Anotace:

Alzheimerova choroba patří mezi tauopatie, což je skupina neurodegenerativních onemocnění projevující se ukládáním hyperfosforylovaných a zkrácených tau proteinů ve formě neurofibrilárních klubek v neuronech a gliích. Cílem praktické části práce bylo analyzovat vzorky krevní plazmy transgenních potkanů s tauopatií a vzorky plazmy kontrolních potkanů. Byla využita metoda cílené metabolomické analýzy krevní plazmy technikou vysokoúčinné kapalinové chromatografie ve spojení s tandemovou hmotnostní spektrometrií a metoda necílené lipidomické analýzy technikou vysokoúčinné kapalinové chromatografie ve spojení s hmotnostním analyzátorem Orbitrap. Cílenou analýzou bylo nalezeno 136 metabolitů. Mezi nejvíce diskriminujícími metabolity byly identifikovány především aminokyseliny a acylkarnitiny. Necílenou analýzou bylo detekováno 1507 neznámých, potencionálních metabolitů, jejichž identifikace není součástí této práce.

Abstract:

Alzheimer's disease is the most prevalent tauopathy. Tauopathies are neurodegenerative diseases characteristic by the deposition of hyperphosphorylated and truncated tau proteins in the form of neurofibrillary tangles located in neurons and glias. The aim of the practical part was to analyze blood plasma samples of transgenic rats with tauopathy and plasma samples of control rats. Targeted metabolomic analysis was performed using high performance liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry and untargeted lipidomic analysis with the Orbitrap mass analyzer. 136 metabolites were identified by the targeted metabolomic analysis. Among the most discriminating metabolites, especially amino acids and acylcarnitines were identified. 1507 unknown metabolites were detected by untargeted analysis, whose identification is not aim of this work.

Klíčová slova

Alzheimerova choroba, tauopatie, tau protein, metabolomika

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 17. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Štěpán Kouřil

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie