Příprava modifikovaných bakteriofágů v genech pro receptor-vazebné proteiny

Bc. Martin Starostka

Diplomová práce

Construction of phages with modified receptor-binding proteins

Anotace:

Receptor-vazebné proteiny, hlavní determinanta hostitelského rozmezí bakteriofágů, jsou častým cílem genových modifikací. Molekulární a syntetická biologie dnes nabízí řadu nástrojů, kterými lze cílit do specifických oblastí fágového genomu poskytujíc tak mechanismy pro změnu tohoto spektra. Práce se zaměřuje na analýzu receptor vazebných proteinů s využitím těchto poznatků pro modifikaci fágového genomu v oblasti těchto genů. Pro modifikaci byl navrhnut a upraven systém editace a selekce využívající mechanismy homologní rekombinace a systém adaptivní imunitní odpovědi CRISPR/Cas.

Abstract:

Receptor-binding proteins, which are major determinant of host range, are very often the target of genetic modification. Molecular and synthetic biology offers many tools to target the specific regions of the phage genome, giving us a way to alter this spectrum. This work focuses on the analysis of receptor-binding proteins. The obtained information is later used to modify the responsible genes. For the purpose of genetic modification, an editing and selection system was designed and edited as required. The system is based on homologous recombination and CRISPR/Cas bacterial adaptive immunity.

Klíčová slova

bakteriofágy, biotechnologie, fágové inženýrství, fágová terapie, receptor-vazebné proteiny, systém CRISPR/Cas, Staphylococcus

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 21. 6. 2022
• Vedoucí: Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D.
• Oponent: Mgr. David Bednář, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Mikrobiologie / Mikrobiologie