Základní mikrobiologické vyšetření hemokultur v automatickém hemokultivačním systému

Hana ŽÁKOVÁ

Bachelor's thesis

The basic microbiological examination of blood cultures in the automated blood culture system

Abstract:

Tato bakalářská práce je zaměřena na téma vyšetření hemokultur v automatickém hemokultivačním systému. V teoretické části se věnuje zejména obecným pojmům přítomnosti bakterií v krvi a rozvoji sepse, dále popsání nejčastějších infekčních agens v hemokulturách u odlišných skupin pacientů a také různým typům hemokultivačních systému od starších po nejnovější. Jsou popsány manuální systémy, jako např. Septi-Chek a Oxoid Signal systém, a automatizované systémy BACTEC a Bact/Alert, které pracují na odlišných principech. Rozebráno je také následné zpracování vzorků k identifikaci mikrobiálních původců a zjištění jejich citlivosti na antibiotika. Cílem bylo osvojit si praktické zpracování hemokultur v automatickém hemokultivačním systému BACTEC. Metodická část je věnována přípravě a zpracování vzorků pro hemokultivaci, následnému postupu inokulace na kultivační půdy a zhotovení mikroskopického preparátu barveného dle Grama. Dále se práce zabývá statistickým zpracováním dat poskytnutých na mikrobiologickém oddělení Nemocnice Písek, a.s., kde probíhalo také osvojení zpracování hemokultur. Statistické šetření bylo prováděno za účelem zjištění mikrobiálního spektra v hemokulturách a procenta pozitivit k celkovému počtu odebraných hemokultur v letech 2014-2018. Za zkoumané období bylo vyšetřeno celkem 9838 hemokultur. Z celkového počtu bylo pozitivních 2338, tzn. 24 %. 76 % hemokultur bylo negativních, nevykazovaly růst mikroorganismů. Mikrobiální spektrum je velmi široké, k nejčastějším nálezům patří Staphylococcus plasmakoagulasa negativní, Escherichia coli, Staphylococcus aureus subsp. aureus, Staphylococcus epidermidis a Klebsiella species.

Abstract:

This bachelor thesis is focused on examination of blood cultures in automatic blood culture system. In the theoretical part, it deals mainly with general terms of the presence of bacteria in the blood and the development of sepsis, as well with the description of the most frequent infectious agents in blood cultures in different groups of patients and also with different types from the oldest to newest blood culture systems. Manual systems are described, such as Septi-Chek and Oxoid Signal System, and automated BACTEC and Bact / Alert systems that work on different principles. The subsequent processing of samples is also discussed to identify microbial agents and determine their susceptibility to antibiotics. The aim was to acquire practical processing of blood cultures in automatic BACTEC hemocultivation system. The methodical part is devoted to the preparation and processing of samples for hemoculture, the subsequent procedure of inoculation on the cultivation soil and the preparation of a microscopic preparation stained by Gram. Furthermore, the thesis deals with the statistical processing of data provided at the microbiological department of the Nemocnice Písek, a.s. The statistical survey was carried out in order to determine the microbial spectrum in blood cultures and the percentage of positivity to the total number of collected blood cultures in 2014-2018. A total of 9838 blood cultures were examined during the study period. Of the total number, 2338 were positive. That is 24%. 76% of blood cultures were negative, did not show growth of microorganisms. The microbial spectrum is very wide, the most common infection agents are Staphylococcus plasmakoagulasa negative, Escherichia coli, Staphylococcus aureus subsp. aureus, Staphylococcus epidermidis and Klebsiella species.

Keywords

Bakteriémie, sepse, infekce krevního řečiště, hemokultura, hemokultivační systém

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 3. 5. 2019

Thesis defence

• Supervisor: MUDr. Věra Kůrková

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Health and Social Sciences

Bachelor programme / field:
Specialization in Health Service / Health Technician