Identifikace a funkční charakterizace měď-transportujících ATPáz u Silenky dvoudomé

Bc. Lubomír Smrža

Master's thesis

Identification and functional characterization of copper transporting ATPases in Silene dioica

Anotácia:

Měď-transportující ATPázy jsou proteiny konzervované v sekvenci, struktuře i funkci napříč mnoha organismy. Zástupci těchto transmembránových přenašečů byly studovány u prokaryot, archeí a z eukaryot u kvasinky a člověka. U rostlin však byly provedeny detailní studie jen u několika druhů. V této diplomové práci se zaměřuji na měď-transportující ATPázy Silenky dvoudomé – rostlinného druhu, u nějž byla pozorována zvýšená tolerance zmíněného těžkého kovu. V práci jsou uvedeny nově získané struktury genů kódujících tyto proteiny, základní bioinformatická analýza známých proteinových sekvencí, porovnání měď-transportujících ATPáz dvou ekotypů Silenky dvoudomé, ověření funkce při transportu mědi, a nakonec lokalizace rostlinné měď-transportující ATPázy v buňce kvasinky.

Abstract:

Copper-transporting ATPases are proteins conserved in sequence, structure and function across many organisms. Representatives of these transmembrane carriers have been studied in prokaryotes, archaea and in eukaryotes yeast and human. In plants however, only a few detailed studies have beed conducted so far. In this diploma thesis I focus on copper-transporting ATPases of Silene dioica – plant species which was reported to have higher tolerance of the mentioned heavy metal. The thesis presents newly obtained structures of genes encoding these proteins, basic bioinformatic analysis of known protein sequences, comparison of copper-transporting ATPases of two ecotypes of S. dioica, confirmation of the copper-transportin function and last but not least localization of plant copper-transporting ATPase in a yeast cell.

Kľúčové slová

Měď-transportující ATPázy, Tolerance mědi, Silene dioica, HMA, P-ATPázy, BAC knihovna, Klonování, Fúzní gen, Copper-transporting ATPases, Copper tolerance, P-ATPases, BAC library, Cloning, Fusion gene

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 10. 5. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 7. 6. 2017
• Vedúci: Ing. Radim Čegan, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics