Vyhledávání potenciálních lektinů v luštěninách

Bc. Žaneta Svobodová

Bachelor's thesis

Searching for potential lectins in legumes

Anotácia:

Lektiny jsou proteiny neimunitního původu schopné rozpoznávat a reverzibilně vázat různé sacharidové struktury. Tato práce se zabývá vyhledáváním lektinů z luštěnin, pomocí laboratorních metod z rostliny Adenanthera pavonina a pomocí bioinformatických metod z jetelu lučního (Trifolium pratense). Pomocí laboratorních metod byl nalezen potenciální lektin, který má hemaglutinační aktivitu. Na základě sekvenční homologie byly v jetelu lučním (Trifolium pratense) identifikovány proteiny podobné známým lektinům. Pro nalezené hypotetické lektiny byla predikována 3D struktura.

Abstract:

Lectins are multivalent proteins of non-immunne origin which recognize and bind reversibly diverse sugar structures. This thesis deals with identification of lectins in legumes, in Adenathera pavonina by laboratory methods and in red clover (Trifolium pratense) by bioinformatic methods. Potential lectin with hemagglutination activity was found using laboratory methods. Proteins in red clover (Trifolium pratense) similar to known lectins were identified based on sequence homology. 3D structures of potential lectins were also predicted.

Kľúčové slová

lektin, luštěnina, Adenanthera pavonina, jetel luční, lectin, legume, red clover

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 11. 5. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2017
• Vedúci: Mgr. Lenka Malinovská, Ph.D., prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Chemoinformatics and Bioinformatics