Vývoj metod volumetrické segmentace medicínských obrazů pro potřeby 3D tisku

Ondřej Sojka

Master's thesis

Development of Volumetric Segmentation Methods of Medical Images for Needs of 3D Printing

Anotácia:

Cílem diplomové práce je přiblížit problematiku volumetrické segmentace medicínských obrazů a 3D tisku. 3D tisk je v dnešní době velmi rozšířený. Ve spojení s medicínou se může jednat o velmi silnou kombinaci. Segmentace obrazu přináší schopnost rozčlenit a klasifikovat určitou zájmovou oblast obrazu z radiodiagnostických metod pro získaní medicínských obrazů. Práce se zabývá výhradně segmentačními metodami aktivních kontur a Otsu metodou, které jsou testovány a simulovány v prostředí softwaru MATLAB. S problematikou 3D tisku se práce věnuje vytvoření STL souboru z výstupu segmentačních metod. Pro toto řešení je v práci vytvořené graficky uživatelské rozhraní. V další části se práce zabývá výsledným 3D tiskem segmentovaných modelů. V závěru jsou zhodnoceny všechny výsledky využitých segmentačních metod i výsledné 3D modely s jejím vizuálním srovnáním.

Abstract:

The aim of the diploma thesis is to approach the issue of volumetric segmentation of medical images and 3D printing. 3D printing is very widespread today. In connection with medicine, it can be a very strong combination. Image segmentation brings the ability to break down and classify a certain area of interest of the image from methods for obtaining medical images. The thesis deals exclusively with segmentation methods of active contours and Otsu method, which I test and simulate in the MATLAB software environment. With the issue of 3D printing, the thesis deals with the creation of an STL file from the output of segmentation methods. A graphical user interface is created for this solution in the thesis. The resulting 3D printing of segmented models is dealt with in the next part. In the end, all the results of the segmentation method used in the thesis and the resulting 3D models with its visual comparison are evaluated.

Kľúčové slová

Volumetrická segmentace, aktivní kontury, Otsu metoda, 3D tisk, 3D tiskárna, nádory, zobrazovací metody

Keywords

Volumetric segmentation, active contours, Otsu method, 3D printing, 3D Printer, tumors, imaging methods

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 30. 4. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 4. 6. 2021
• Vedúci: Jan Kubíček
• Oponent: Martin Nedopil

VSB – Technical University of Ostrava

Fakulta elektrotechniky a informatiky

Master programme:
Biomedicínské inženýrství