Genetická charakterizace kmenů cirkoviru prasat 2 v ČR

Bc. Eva Slaninková

Diplomová práce

Genetic characterization of Porcine circovirus 2 strains in the Czech Republic

Anotace:

Cirkovirus prasat 2 je původcem ekonomicky významných onemocnění, jejichž patogeneze nebyla dosud zcela objasněna. V ČR se vyskytují genotypy PCV2-skup.1 a PCV2-skup.2. Po genetickém shiftu, který proběhl v ČR nejpozději v roce 2002, byl genotyp PCV2-skup.2 vytlačen a vyskytuje se již pouze sporadicky. Genotyp PCV2-skup.1 však nelze na základě našich pozorování považovat za virulentnější, protože byl prokázán i v případě subklinických infekcí. Protein kódovaný ORF3 se také uplatňuje v patogenezi cirkovirových onemocnění. Sekvenováním několika kmenů jsme prokázali, že se jedná o velmi konzervovanou část virového genomu a nenalezli jsme v ní molekulární markery se zjevným vztahem k virulenci kmenů.

Abstract:

Porcine circovirus 2 is a causative agent of economically important diseases whose pathogenesis has not been fully elucidated yet. There are genotypes PCV2-group1 and PCV2-group2 occuring in the Czech Republic. After a genetic shift that took place no later than 2002 in the Czech Republic, the genotype PCV2-group2 has been replaced by PCV2-group1 and now appears sporadically only. The genotype PCV2-group1 can’t be regarded as more virulent, as it was proved in many subclinical infections. The protein encoded by ORF3 plays a role in the pathogenesis of the circovirus diseases. Its nucleotide sequence is very conserved and we haven´t found any molecular markers which could be linked to the virulence of sequenced strains.

Klíčová slova

Cirkovirus, prase, genotypizace, sekvenování, circovirus, pig, genotypization, sequencing

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2011

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2011
• Vedoucí: prof. MVDr. Vladimír Celer, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Obecná biologie