Výskyt ESBL kmenů v Nemocnici Písek, a.s.

Michaela KOTHÁNKOVÁ

Bachelor's thesis

Occurrence of ESBL strains in Hospital Pisek, Inc.

Abstract:

Rezistence na ATB je čím dál větším problémem na celém světě. Rezistence se u bakterií vyskytuje přirozeně nebo rezistenci získají genovými mutacemi, kde dochází k předání genetické informace mezi rody či druhy. Tyto kmeny jsou poté rezistentní k antibiotikům, která jsou jinak účinná. Největším problémem je, že v těchto případech se prodlužuje léčba, zvyšuje se mortalita i morbidita pacientů a zvyšují se především náklady léčby. Úvodní teoretická část práce je věnována charakteristice a typům účinku antimikrobiálních látek, beta-laktamovým antibiotikům, rezistenci na antibiotika, kde jsou popsány cesty přenosu rezistence, multirezistence a mechanismy rezistence. Dále je tato část věnována beta-laktamázám a jejich klasifikaci, širokospektrým beta-laktamázám (ESBL) a jejich producentům, zejména rodu Klebsiella, rodu Escherichia, rodu Enterobacter a rodu Proteus. Poslední kapitola této části je zaměřena na dopad rezistence na terapii a možnosti léčby. Metodická část práce byla prováděna na Oddělení klinické mikrobiologie Nemocnice Písek, a.s., kde byl sledován záchyt ESBL pozitivních kmenů rodu Klebsiella, rodu Escherichia, rodu Enterobacter a rodu Proteus během jednoho roku (leden-prosinec 2016). Tato část práce je zaměřena na mikroby zmiňovaných rodů a jejich citlivosti k antibiotikům. V případě testování citlivosti se jedná o diskový difúzní test založený na inhibiční zóně a o bujonovou mikrodiluční metodu, která je založena na minimální inhibiční koncentraci. Dále tato část popisuje vyšetření produkce ESBL, kde je popsán screeningový test pomocí chromogenní půdy Brilliance ESBL agar a metoda průkazu produkce ESBL a AmpC nazývaná MAST test. Poslední kapitola této části je věnována kontrole kvality. V praktické části práce nalezneme porovnání výskytu bakterií rodu Klebsiella, rodu Escherichia, rodu Enterobacter, rodu Proteus a jejich produkce ESBL. Dále je tato část věnována rozdělení izolátů s produkcí ESBL dle typu nemocničního oddělení, kde byl zjištěn největší záchyt na oddělení následné péče a oddělení sociálních lůžek. Tato část také popisuje rozdělení izolátů produkujících ESBL dle typu klinického materiálu, kde byl obrovský záchyt v moči. Dále byl porovnán počet producentů ESBL v nemocnici a komunitě, kde byl zjištěn 85 % výskyt v nemocnici, což se předpokládalo.

Abstract:

Resistance to ATB is becoming a big problem all round the world. Bacterial resistance occurs naturally or is obtained by gene mutations where genetic information is transmitted between genera or species. These strains are then resistant to antibiotics that are otherwise effective. The biggest problem is that in these cases the treatment is prolonged, the mortality and morbidity of the patients increases and the costs of the treatment as well. The initial theoretical part is devoted to the characteristics and types of effects of antimicrobial agents, beta-lactam antibiotics, antibiotic resistence, where resistance transfer process, multiresistance and resistance mechanisms are described. Further, this part is dedicated to beta-lactamases and their classification, broad-spectrum beta-lactamases (ESBL) and their producers, especially the genus Klebsiella, the genus Escherichia, the genus Enterobacter and the genus Proteus. The last chapter of this part is focused on the impact of resistance to therapy and treatment options. A methodical part of this work was performed at the Department of Clinical Microbiology of Písek Hospital, Inc., where the detection of ESBL positive strains of the genus Klebsiella, Escherichia, Enterobacter and Proteus was observed during one year (January-December 2016). This part focuses on microbes of the mentioned genera and their antibiotic susceptibility. For susceptibility testing, this is a disk diffusion test based on the inhibition zone and a bouillon microdilution method, which is based on minimum inhibitory concentration. Further, this part also deals with an ESBL production test where a screening test using Brilliance ESBL agar chromogenic soil and method of detection ESBL and AmpC production (known as the MAST test) are described. The last chapter of this part is dedicated to quality control. In the practical part of the thesis, we can compare the incidence of bacteria genus Klebsiella, genus Escherichia, genus Enterobacter, genus Proteus and their production of ESBL. Further, this part is focused on the distribution of isolates with ESBL production according to the type of hospital department, the highest incidence was found in the department of aftercare and department of social beds. This section also describes the distribution of ESBL-producing isolates according to the type of clinical material, where there was a huge catch in the urine. It was also compared the number of ESBL producers in the hospital and the community where it was found 85% incidence in the hospital, which was expected.

Keywords

bakteriální rezistence, beta-laktamová antibiotika, širokospektrá beta-laktamáza, rod Klebsiella, rod Escherichia, rod Enterobacter, rod Proteus

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 3. 5. 2018

Thesis defence

• Supervisor: MUDr. Věra Kůrková

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Health and Social Sciences

Bachelor programme / field:
Specialization in Health Service / Health Technician