Genotypizace genu EGFR u pacientů s karcinomem

Bc. Hana NOSKOVÁ

Master's thesis

EGFR genotyping in patients with carcinoma

Abstract:

EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor - také HER1 a ERBB) je transmembránový receptor s tyrozin-kinázovou aktivitou ERBB2 rodiny, jehož aktivace po vazbě příslušného ligandu vede ke spuštění dráhy intracelulární signalizační kaskády, která ovlivňuje expresi řady genů podílejících se na buněčné proliferaci. Pro některé typy nádorových onemocnění je typická zvýšená aktivita této EGFR signální dráhy, což přispívá jak k proliferaci nádorových buněk, tak k růstu nádoru, jeho invazivitě a krevnímu zásobení, tvorbě metastáz a inhibici apoptózy buněk. Mezi tato onemocnění patří také nemalobuněčný karcinom plic (NSCLC), který se vyskytuje přibližně u 80 % případů pacientů s karcinomem plic. Jedná se o agresivní nádor, který je v dnešní době nejčastější příčinou úmrtí na rakovinu. Mutace v genu EGFR, zejména ty, které se nacházející v jeho tyrosinkinázové doméně v exonech 18 - 21, se významně podílejí na projevu onemocnění, tzn. jeho závažnosti a zároveň určují možnosti jeho léčby. Cílem teoretické části práce bylo seznámení se se současnou problematikou genu EGFR a proteinu EGFR, možnostech léčby nádorového onemocnění pomocí látek namířených proti EGFR a metodami umožňujícími detekci mutací v genu EGFR. Praktická část práce byla zaměřena na optimalizaci kvantitativní real-time analýzy pro jednoduchou a citlivou detekci 19 nejčastějších typů delecí v exonu 19 a bodové mutace L858R (2573T>G) v exonu 21, které společně tvoří až 90 % část všech mutací genu EGFR s aktivovanou tyrozin-kinázovou aktivitou a porovnat data pacientů vyšetřených na přítomnost mutace v genu EGFR v LEM při Dětské klinice, Lékařská fakultě Univerzity Palackého a FN v Olomouci s daty získanými celosvětovými studiemi.

Abstract:

EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor - also HER1 and ERBB) is a transmembrane receptor with tyrosine-kinase activity, whose activation by the ligand binding leads to starting up of the intracellular signaling cascade, which affects the expression of many genes involved in the cell proliferation. Some types of cancer are characterized by increased activity of the EGFR signaling pathway, which contributes to the proliferation of tumor cells and the tumor growth, invasiveness and its blood supply, metastasis and inhibition of apoptosis of cells. Non-small cell lung cancer (NSCLC) also belongs to these diseases occuring in about 80% of patients with lung cancer. NSCLC is an aggressive tumor that is currently the most common cause of death from cancer. EGFR mutations, especially those located in its tyrosin-kinase domain in exons 18 to 21, significantly contribute to the symptoms and severity of disease, and also determine options of treatment. The theoretical part´s aim of this thesis was to get familiar with current knowledge of EGFR gene and EGFR protein, treatment options by using EGFR antagonists and current possibilities in detection of mutations in EGFR gene. The practical part was focused on the optimalization of quantitative real-time PCR assay for simple and sensitive detection of 19 most common types of deletions in exon 19 and single nucleotide substitution L858R (2573T > G) in exon 21, which together make up 90 % of all tyrosine-kinase activating EGFR mutations. This thesis also compares data of patients examined for EGFR mutations in Laboratory of Experimental Medicine associated with Children´s Clinique, Medical Faculty of Palacky University and Faculty Hospital in Olomouc, with data gained in global studies.

Keywords

EGFR, mutace, nemalobuněčný karcinom plic, real-time PCR, ARMS

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 2. 8. 2011

Accessible from:: 2. 8. 2011

Thesis defence

• Supervisor: Doc. Mgr. Jiří Drábek, Ph.D.

PALACKÝ UNIVERSITY IN OLOMOUC

Faculty of Science

Master programme / field:
Biology / Molecular and Cell Biology