Optimalizovaná implementace korektoru sekvenačních chyb ECHO – Bc. Miloš Šimek
Bc. Miloš Šimek
Diplomová práce
Optimalizovaná implementace korektoru sekvenačních chyb ECHO
Optimized implementation of the sequencing error corrector ECHO
Anotace:
Předmětem diplomové práce „Optimalizovaná implementace korektoru sekvenačních chyb Echo“ je nová efektivní implementace algoritmu, který opravuje chyby zanesené v sekvencích genetické informace. Důležitou součástí je program navrhnout tak, že jeho běh bude časově kratší, než již existující alternativa. Součástí práce je uživatelská dokumentace a další možnosti optimalizace struktury a běhu programu …víceAbstract:
The goal of this thesis: “Optimized implementation of the sequencing error corrector Echo” is more efective implementation of algorithm, which repairs errors in sequences of genetical information. Important part is to design program in a way, that it’s running time will be shorter in comparison with existing alternative. Thesis also includes user documentation and other ways how to improve structure …více
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 26. 5. 2014
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/br6o1/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 24. 6. 2014
- Vedoucí: Mgr. Aleš Křenek, Ph.D.
- Oponent: RNDr. Igor Peterlík, Ph.D.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasarykova univerzita
Fakulta informatikyMagisterský studijní program / obor:
Aplikovaná informatika / Aplikovaná informatika
Práce na příbuzné téma
-
Vliv vnitrobuněčného prostředí na rovnováhu duplex-tetraplex v guanin- (G-) a cytosin- (C-) bohaté DNA
Vladimíra Zlínská -
Studium interakcí hPOT1 s jednořetězcovými G- a C-bohatými přesahy telomerické DNA.
Michala Bučková -
NMR charakterizace C3GAGA DNA sekvence
Aleš Novotný -
Charakterizace alternativních sekvenčních motivů v C-bohaté telomerní DNA
Daniel Krafčík