Optimalizovaná implementace korektoru sekvenačních chyb ECHO – Bc. Miloš Šimek
Bc. Miloš Šimek
Master's thesis
Optimalizovaná implementace korektoru sekvenačních chyb ECHO
Optimized implementation of the sequencing error corrector ECHO
Abstract:
Předmětem diplomové práce „Optimalizovaná implementace korektoru sekvenačních chyb Echo“ je nová efektivní implementace algoritmu, který opravuje chyby zanesené v sekvencích genetické informace. Důležitou součástí je program navrhnout tak, že jeho běh bude časově kratší, než již existující alternativa. Součástí práce je uživatelská dokumentace a další možnosti optimalizace struktury a běhu programu …moreAbstract:
The goal of this thesis: “Optimized implementation of the sequencing error corrector Echo” is more efective implementation of algorithm, which repairs errors in sequences of genetical information. Important part is to design program in a way, that it’s running time will be shorter in comparison with existing alternative. Thesis also includes user documentation and other ways how to improve structure …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 26. 5. 2014
Identifier:
https://is.muni.cz/th/br6o1/
Thesis defence
- Date of defence: 24. 6. 2014
- Supervisor: Mgr. Aleš Křenek, Ph.D.
- Reader: RNDr. Igor Peterlík, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsMaster programme / field:
Applied Informatics / Applied Informatics
Theses on a related topic
-
Vliv vnitrobuněčného prostředí na rovnováhu duplex-tetraplex v guanin- (G-) a cytosin- (C-) bohaté DNA
Vladimíra Zlínská -
Studium interakcí hPOT1 s jednořetězcovými G- a C-bohatými přesahy telomerické DNA.
Michala Bučková -
Charakterizace alternativních sekvenčních motivů v C-bohaté telomerní DNA
Daniel Krafčík -
NMR charakterizace C3GAGA DNA sekvence
Aleš Novotný