Studium laserem indukovaného oxidativního značení aminokyselin a peptidů

Mgr. Kristína Piliarová

Bakalářská práce

Study of laser induced oxidative labeling of amino acids and peptides

Abstract:

In this thesis, fast photochemical oxidation labeling of peptides and amino acids with hydroxyl radicals photolytically generated from hydrogen peroxide was studied. The amino acids and peptides and their oxidation product were detected using a MALDI TOF mass spectrometer. First, study of oxidation of the amino acids using hydrogen peroxide was conducted. Based on the results, peptides suitable for photochemical labelling were selected. The sample of the peptide was mixed with hydrogen peroxide and introduced to the quartz capillary, where generation of hydroxyl radicals using UV laser took place. The oxidized sample was deposited on the steel target and analyzed by MALDI MS.

Abstract:

V této bakalářské práci se věnujeme rychlé fotochemické oxidaci peptidů a aminokyselin, za účelem jejich značení hydroxylovými radikály vznikajícími fotolýzou peroxidu vodíku. Aminokyseliny, peptidy a jejich oxidační produkty byly detekovány pomocí MALDI TOF hmotnostního spektrometru. V práci byla nejdříve provedena studie oxidace aminokyselin pomocí peroxidu vodíku a na jejím základě byly vybrány peptidy potenciálně vhodné pro fotochemické značení. Vzorek peptidu byl smíchán s peroxidem vodíku a nadávkován do křemenné kapiláry, kde proběhlo fotolytické generování hydroxylových radikálů pomocí UV laseru. Zoxidovaný vzorek byl nanesen na ocelovou destičku a podroben MALDI MS analýze.

Klíčová slova

FPOP, fotochemická oxidace peptidů, MALDI, TOF, MS/MS, aminokyseliny, peptidy, hmotnostní spektrometrie, matrice, laser, methionin, cystein, arginin, tryptofan, photochemical oxidation of peptides, amino acids, peptides, mass spectrometry, matrix, methionine, cysteine, arginine, tryptophan

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 28. 5. 2014

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 24. 6. 2014
• Vedoucí: prof. Mgr. Jan Preisler, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Chemie / Chemie