Identifikace bioaktivních molekul na automatizované HTS platformě

Vojtěch SYNEK

Bakalářská práce

Identification of bio-active molecules in automated HTS platform

Anotace:

Vysokokapacitní testování je prvním krokem v hledání nových léčiv. Jedná se o metodu testování velkého počtu látek za účelem jejich použití ve farmaceutickém průmyslu. Poznatky z tohoto testování vedou k výběru aktivních látek, které se posouvají do dalších testů. Velkou výhodou této metody je její účinnost, rychlost a cena. K dosažení těch nejlepších výsledků je zapotřebí automatizovaného robotického systému, citlivých detektorů a výkonného softwaru. V práci bylo otestováno 268 látek pomocí MTS testu a rozděleno na aktivní a neaktivní. Aktivita látek byla testována v 384- jamkových destičkách na buněčných liniích nádorových i nenádorových. Data byla vyhodnocena pomocí softwaru Dotmatics. Ze souboru aktivních látek byly vybrány 3 látky, u nichž byl otestován buněčný cyklus, syntéza DNA a RNA a fosforylace histonu H3. Analýza byla provedena pomocí cytometru FACS Calibur a data byla vyhodnocena v softwaru CellQuest.

Abstract:

Bioactive molecules are evaluated using high throughput screening. It is a way of testing large number of compounds in the purpose of using them in pharmaceutical industry. High- throughput screening is the first step in finding new drugs. Findings from the test lead to selection of active compounds. A great advantage of this method is its efficiency, speed and cost. The method needs automated robotic system, sensitive detectors and efficient software to achieve the best results. In this thesis 268 compounds were tested via MTS test and sorted as active or inactive. The activity of the compounds was tested in 384- well plates on tumor and non-tumor cell lines. The data were validated via the Dotmatics software. Three compounds were selected from the set of active compounds and cell cycle, DNA and RNA synthesis and histone H3 phosphorylation of the three compounds was analyzed. Analysis was done on cytometer FACS Calibur and the data were validated via the CellQuest software.

Klíčová slova

HTS, MTS test, IC50, analýza buněčného cyklu, CCRF-CEM

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 26. 4. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Soňa Gurská, PhD.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie