Role sestřihu mRNA v hormonálních drahách rostlin

Bc. Viktor Dressler

Master's thesis

The role of mRNA splicing in plant hormonal pathways

Anotácia:

Táto diplomová práce je věnována fytohormonu s názvem abscisová kyselina. Konkrétní zaměření je na gen ABSCISIC ACID INSENSITIVE2 (ABI2), který kóduje protein fosfatázu 2C, která je přímo zapojena v signální dráze abscisové kyseliny. V teoretické části byla vypracovaná literární rešerše shrnující základné údaje o abcsisové kyselině a přenosu jejího signálu v rostlinné buňce. Jsou zde také podány základní informace o alternativním sestřihu a o metodě nazývané kvasinkový dvouhybridní systém (Y2H). V experimentální časti bylo testováno, zda alternativní sestřih ovlivňuje přenos signálu abscisové kyseliny. Byly potvrzeny alternativní transkripty genu ABI2 a testovány bimolekulární interakce pomocí Y2H. Detekované změny v síle interakcí proteinu ABI2 a jeho interakčními partnery naznačují, že se alternativní sestřih může na více úrovních podílet na modulaci signálních drah abscisové kyselin.

Abstract:

This thesis deals with a phytohormone called abscisic acid. The specific focus is on the ABSCISIC ACID INSENSITIVE2 (ABI2), which encodes a phosphatase 2C protein that is directly involved in the abscisic acid signaling pathway. In the theoretical part a literature review was elaborated summarizing basic data on abscisic acid and its signal transmission in plant cell. There is also basic information about alternative splicing and a method called yeast two-hybrid system (Y2H). In the experimental part, it was tested whether alternative splicing affects the transmission of abscisic acid signal. Alternative transcripts of gene ABI2 were confirmed and protein interactions were tested with Y2H. The observed changes of the strength of interactions between ABI2 protein isoforms and its interaction partners suggest that alternative splicing may be involved at multiple levels in the modulation of abscisic signaling pathways.

Keywords

abscisová kyselina, fytohormon, hormonální dráha, alternativní sestřih, kvasinkový dvouhybridní systém, ABI2, Abscisic acid, phytohormone, hormonal pathway, alternative splicing, yeast two-hybrid system

Jazyk práce: English

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 4. 6. 2019
• Vedúci: Mgr. Kamil Růžička, Dr. rer. nat.
• Oponent: Ph.D. Helene Robert Boisivon

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry