Zpět na vyhledávání

Bc. Kateřina Pohanová

Bachelor's thesis

Pipeline pro analýzu dat z cíleného stanovení bakteriálních kmenů pomocí multiplex qPCR

Development of pipeline for analysis of data from targeted sequencing of bacterial strains using multiplex qPCR
Abstract:
Multiplexní kvantitativní polymerázová řetězová reakce (qPCR) představuje mocný nástroj pro detekci a kvantifikaci více bakterií v jediné reakci. Analýza komplexních dat generovaných multiplexní qPCR však může být zdlouhavá a náročná. Tato bakalářská práce se zabývá touto problematikou zavedením pipeline napsané v jazyku R, která je speciálně navržena pro zefektivnění analýzy dat multiplexní qPCR pro …more
Abstract:
Multiplex quantitative polymerase chain reaction (qPCR) is a powerful method for detecting and quantifying multiple bacterial targets within a single reaction. However, analyzing the complex data generated by multiplex qPCR can be time-consuming and challenging. This thesis addresses this challenge by introducing an R-based pipeline specifically designed to streamline the analysis of multiplex qPCR …more
 

Keywords

kvantitativní polymerázová řetězová reakce multiplexní kvantitativní polymerázová řetězová reakce pipeline analýza dat program R quantitative polymerase chain reaction multiplex quantitative polymerase chain reaction data analysis
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 5. 2024
Identifier: https://is.muni.cz/th/d09hq/

Thesis defence

  • Date of defence: 21. 6. 2024
  • Supervisor: Mgr. Jan Böhm
  • Reader: Mgr. Barbora Zwinsová

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta
Složka Reference to the local database directory of the institution