Pipeline pro analýzu dat z cíleného stanovení bakteriálních kmenů pomocí multiplex qPCR – Bc. Kateřina Pohanová
Bc. Kateřina Pohanová
Bachelor's thesis
Pipeline pro analýzu dat z cíleného stanovení bakteriálních kmenů pomocí multiplex qPCR
Development of pipeline for analysis of data from targeted sequencing of bacterial strains using multiplex qPCR
Abstract:
Multiplexní kvantitativní polymerázová řetězová reakce (qPCR) představuje mocný nástroj pro detekci a kvantifikaci více bakterií v jediné reakci. Analýza komplexních dat generovaných multiplexní qPCR však může být zdlouhavá a náročná. Tato bakalářská práce se zabývá touto problematikou zavedením pipeline napsané v jazyku R, která je speciálně navržena pro zefektivnění analýzy dat multiplexní qPCR pro …moreAbstract:
Multiplex quantitative polymerase chain reaction (qPCR) is a powerful method for detecting and quantifying multiple bacterial targets within a single reaction. However, analyzing the complex data generated by multiplex qPCR can be time-consuming and challenging. This thesis addresses this challenge by introducing an R-based pipeline specifically designed to streamline the analysis of multiplex qPCR …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 5. 2024
Identifier:
https://is.muni.cz/th/d09hq/
Thesis defence
- Date of defence: 21. 6. 2024
- Supervisor: Mgr. Jan Böhm
- Reader: Mgr. Barbora Zwinsová
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
POHANOVÁ, Kateřina. \textit{Pipeline pro analýzu dat z cíleného stanovení bakteriálních kmenů pomocí multiplex qPCR}. Online. Bachelor's thesis. Brno: Masaryk University, Faculty of Science. 2024. Available from: https://theses.cz/id/gdjca6/.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceBachelor programme / field:
Computational biology and biomedicine / Biomedical bioinformatics
Theses on a related topic
-
Návrh a optimalizace multiplex RT-PCR pro paralelní analýzu míry exprese (sub)isoforem metalothioneinů
František Petrlák -
Optimalizace multiplex PCR pro současnou detekci kolicinů a mikrocinů
Lucie JANÁKOVÁ -
Control of the polymerase chain reaction by magnetic nanoparticles
Ivana Pivarníková -
Data analysis of production defect data
Veronika Aksamítová -
Complex Data Analysis by Mining and Searching Operations
Jakub Peschel -
Analýza dat a návrh datového skladu pro firmu z oblasti logistiky;
Jiří Doležálek -
Computational Methods for Multimodal Omics Data Analysis
Anna Pačínková -
Overview and Analysis of Data Vault 2.0 - Flexible Data Warehousing Methodology
Adam Hospodka